Na rijeci Mississippi žive brojne vodene biljke i životinje u složenom, međusobno povezanom ekosustavu. Vodene biljke pružaju hranu i sklonište mnogim različitim vrstama u rijeci, a mogu biti male kao jednoćelijske alge. Na rijeci Mississippi nalazi se niz životinja, od beskralješnjaka do riba, žaba i drugih.
Alge
Prema Odjelu za prirodne resurse u Iowi, Mississippi je domaćin dvije glavne vrste algi: zelenoj i plavo-zelenoj. Zelene alge osnovna su biološka komponenta svakog zdravog ekosustava; stvaraju velike kolonije koje mogu dati vodi zelenkast odljev. Plavozelene alge su manje poželjne i smatraju se algama koje smetaju. Povezani su sa stresnim ekosustavima i mogu izazvati neugodne okuse u ribi ili ubiti cijelu populaciju.
Vodena leća
Ova uobičajena slobodno plutajuća biljka ima jedan sitni list i korijenje koje se visi u vodi kako bi usisalo hranjive sastojke. Kao što naznačuje njeno ime, duckweed je važan izvor hrane za mnoge vodene ptice.
Lopoči
Bijeli lopoči često su mjesto na rijeci Mississippi, a sastoje se od velikih, plutajućih listova kožne teksture. Na vrhu lišća daju velike bijele cvjetove, a ukorijenjeni su u blatu odozdo.
Rakovi
Također se nazivaju rakovi ili rakovi, ovi rakovi nalikuju malim jastozima. Prvenstveno su hranilice na dnu i troše ostatke drugih životinja, strvine i malih životinja. U rijeci Mississippi žive i domaći i invazivni rakovi.
Som
Kanalski somovi uobičajeni su prizor u rijeci Mississippi. Oni su najbrojnija vrsta soma. Te ribe mogu narasti do iznenađujuće veličine i prije svega se pridržavaju riječnog dna. Značajni su po tendenciji udaranja na razne vrste mamaca, ali trebali bi ih jesti rijetko zbog opasnosti od onečišćenja PCB-om (polikloriranim bifenilom).
Leopard žaba
Ove pjegave žabe nazivaju se i livadskim žabama. Žive u i oko rijeke Mississippi. Oni često služe kao indikatorska vrsta okoliša zbog svoje osjetljivosti na onečišćenja i onečišćenja. Većinu vremena provode uz rubove potoka i drugih vodenih površina, a uglavnom jedu insekte, člankonošce i druge beskičmenjake.
