Postoji mnogo različitih vrsta ekosustava. Vodeni ekosustavi čine velik dio svjetskih ekosustava i mogu se klasificirati ili kao slatkovodni ekosustavi ili morski ekosustavi. Stanovnici bilo koje vrste ekosustava bit će prilagođeni preživljavanju u određenom nizu uvjeta koje predstavlja taj ekosustav.
Ekosustav je zajednica koja je složena u interakciji između biotičkih i abiotskih čimbenika na određenom području. Biotički čimbenici ekosustava su živi dijelovi poput biljaka, životinja, bakterija i gljivica. Abiotski čimbenici uključuju tlo, vodu i ostale nežive predmete prisutne u okolišu. Ekosustav može biti velik poput pustinje ili malen poput bazena s plimom. Živih bića bit će samo onoliko koliko se može podržati opskrbom hranom. Interakcije poput predatora i plijena i odnosa s mrežom hrane određuju populaciju ekosustava. Svako živo biće mora ispuniti svoju ulogu koja pridonosi ukupnom uspjehu i opstanku ekosustava.
Pojam morski odnosi se na ekosustav povezan s oceanima. Prema Agenciji za zaštitu okoliša (EPA), morski ekosustavi čine približno 70 posto svjetskih ekosustava. Morski ekosustavi jedinstveni su zbog suspendiranih otopljenih spojeva u vodi, ponajviše soli. Sićušni organizmi poput mikroskopskog planktona i veliki poput kitova nastanjuju razne vrste morskih ekosustava. Morski ekosustavi uključuju oceane, ušća i slane močvare, koraljne grebene, šume mangrovih šumara, lagune, korita morske trave algi i zonu međuplima koja se proteže na plažama.
Postoje mnoge vrste slatkovodnih ekosustava. Rijeke, jezera, bare i potoci najčešći su izvori slatke vode. Rezervoari, močvare i izvori podzemnih voda također se smatraju slatkovodnim ekosustavima. Slatkovodni ekosustavi ne sadrže iste otopljene tvari u vodi kao morski ekosustavi, pa životinje i biljke koje tamo žive ne bi preživjele u morskom ekosustavu. Budući da slatka voda ne sadrži sol, osjetljivija je na smrzavanje i odmrzavanje. Slatkovodne biljke i životinje prilagodile su se preživljavanju ovog procesa. Oni također imaju respiratorne strukture prilagođene posebno za slatkovodne vode i razvili su reproduktivno i prehrambeno ponašanje koje im omogućuje uspješan opstanak u njihovom okruženju.
