Gljivice i alge često se miješaju i o njima se naizmjenično raspravlja. Doista, mahovinski lišaj koji se često nalazi na kamenju i drveću zapravo je kombinacija gljivica i nekog oblika algi; međutim, gljive i alge su zapravo u većini aspekata prilično različite. Primjerice, dok su alge član protista kraljevstva, gljive su dio biljnog carstva. Uz to, za razliku od mnogih gljivica, algama nedostaje bilo kakav oblik korijena ili stabljika. Ipak, unatoč značajnim razlikama, postoje neke sličnosti između gljivica i algi.
Mnoge sorte
Algama i gljivama je zajedničko to što ta dva pojma obuhvaćaju širok spektar vrsta. Na primjer, gljive ne uključuju samo gljive i veće gljive koje su mnogima poznate, već i mikroskopske sorte, poput kvasca. Te sorte postoje u gotovo svim ekosustavima na zemlji.
Slično tome, alge se također kreću od mikroskopskih organizama, poput jednoćelijskih organizama, do ogromnih algi, koje mogu narasti i do 65 metara. Prema Nacionalnom prirodoslovnom muzeju Smithsonian, u američkoj zbirci algi nalazi se gotovo 300 000 primjeraka. Baš kao što su gljive geografski široko rasprostranjene, tako se i sorte algi mogu naći širom svijeta u raznim okruženjima, uključujući neke od najekstremnijih okoliša na zemlji.
Vlažna okruženja
Gljivice i alge radije žive u vlažnom okruženju. Zapravo, jedna od dobrobiti algi koja proizlazi iz njihovog odnosa simbiotskog lišaja s gljivicama jest njihova sposobnost preživljavanja na kopnu u vlažnom okolišu.
Iako gljive preferiraju vlažno okruženje, gljivične vrste mogu se naći u gotovo bilo kojem okruženju, uključujući pustinje.
Algama je za opstanak potrebno više vlage nego gljiva. Zapravo, većina algi nalazi se u vodenom okruženju, poput jezera i oceana, iako se mogu naći i u kopnenom okruženju.
Haploidne jezgre
I gljive i alge općenito su primjeri organizama koji posjeduju haploidne jezgre. To znači da imaju samo jednu kopiju svakog kromosoma. Suprotno tome, diploidni organizmi, poput ljudi i većine sisavaca, imaju po dvije kopije svakog kromosoma.