Zagađenje tla ima mnogo uzroka. Kontaminanti se mogu izravno uvesti. Tlo se može kontaminirati onečišćenjem zraka kada oborine talože kisele spojeve poput sumpornog dioksida i dušikovog oksida. Ljudske aktivnosti poput rudarstva mogu osloboditi kiselu drenažu koja može imati široko rasprostranjene učinke. Bez obzira na uzrok, onečišćenje tla ima negativne učinke na biljke i floru, kao i na organizme koji o njima ovise.
Mikroorganizmi
Kisela tla nastala taloženjem kiselih spojeva poput sumpornog dioksida stvaraju kiselo okruženje koje to nije podnose ga mikroorganizmi koji poboljšavaju strukturu tla razbijanjem organskog materijala i pomaganjem u vodi teći.
Fotosinteza
Tla zagađena kiselom kišom utječu na biljke narušavajući kemiju tla i smanjujući sposobnost biljaka da uzimaju hranjive sastojke i podvrgavaju se fotosintezi.
Aluminij
Dok se aluminij prirodno javlja u okolišu, onečišćenje tla može mobilizirati anorganske oblike, koji su vrlo otrovni za biljke i potencijalno se mogu isprati u podzemnu vodu, čineći ih složenim efekti.
Cvjetanje algi
Kontaminirana tla s visokom razinom dušika i fosfora mogu se isprati u vodene putove, uzrokujući cvjetanje algi, što rezultira smrću vodenih biljaka uslijed osiromašenja otopljenog kisika.
pH
Kiselo taloženje u tlu može otežati njegovu sposobnost puferiranja promjena pH tla, uzrokujući odumiranje biljaka zbog negostoljubivih uvjeta.