Centrifuga je uređaj koji se sastoji od pretinca koji se vrti na središnjoj osi. Kretanje predenja uzrokuje odvajanje materijala na temelju njihove različite gravitacije. Rotor centrifuge je rotirajuća jedinica centrifuge koja ima fiksne rupe izbušene pod kutom. Epruvete su smještene unutar ovih rupa, a rotor se okreće kako bi se pomoglo u odvajanju materijala. Postoje tri vrste rotora za centrifuge: rotor s kliznom kašikom, rotor s fiksnim kutom i vertikalni.
Rotor s okretnom kašikom obično podržava uzorke u rasponu od 36 ml do 2,2 ml. Ljuljačke kante mogu podržati dvije vrste odvajanja: zonsko-stopovno i izopikničko. Žlice za zamah poželjne su za razdvajanje zona od brzine, jer je udaljenost između vanjske strane meniskusa i vanjske strane dna cijevi dovoljna da se dogodi odvajanje.
Rotori s fiksnim kutom obično se koriste za nanošenje peleta na čestice peleta iz suspenzije i uklanjanje suvišnih ostataka ili za prikupljanje peleta. Šupljine rotora kreću se od 0,2 ml do 1 ml. Najvažniji aspekt odluke o korištenju rotora s fiksnim kutom je faktor K. K faktor pokazuje koliko učinkovito rotor može peletirati pri maksimalnoj brzini. Što je niži faktor K, to je veća učinkovitost peletiranja.
Vertikalni rotori su visoko specijalizirani. Obično se koriste za vezivanje DNA u cezijev klorid. Vertikalni rotori imaju vrlo niske K faktore, što je korisno ako se čestica mora pomicati samo na kratkoj udaljenosti dok se ne peletira. Vrijeme rada na vertikalnim rotorima je kratko.