डीएनए में कई मरम्मत मार्ग हैं। एक प्रकाश में घटित होना चाहिए, और कई अंधेरे में घटित हो सकते हैं। इन तंत्रों को इस बात से अलग किया जाता है कि क्रिया करने के लिए आवश्यक एंजाइम सूर्य से अपनी ऊर्जा प्राप्त करते हैं या नहीं।
यूवी प्रकाश की उपस्थिति में डीएनए के दो आधार परस्पर जुड़े हो सकते हैं। यह क्रॉस-लिंकिंग डीएनए प्रतिकृति सहित विभिन्न प्रकार की सेलुलर प्रक्रियाओं को होने से रोकता है।
प्रकाश की मरम्मत में, photolyase नामक एक एंजाइम यूवी क्षति के कारण क्रॉस-लिंक्ड डीएनए को साफ करता है। Photolyase को सूर्य की ऊर्जा की आवश्यकता होती है।
डार्क प्रतिक्रियाएं डीएनए में क्रॉस-लिंक को साफ करने के लिए एन-ग्लाइकोसिलेज नामक एंजाइम का उपयोग करती हैं। विशेष रूप से, एन-ग्लाइकोसिलेज को सूर्य से ऊर्जा की आवश्यकता नहीं होती है।
पुनर्संयोजन मरम्मत भी एक डीएनए मरम्मत तंत्र है जिसमें प्रकाश की आवश्यकता नहीं होती है। डीएनए प्रतिकृति मशीनरी क्रॉस-लिंक्ड डीएनए बेस में दोहराई नहीं जा सकती है। हालांकि, यह एक अंतर छोड़कर, पार छोड़ सकता है। प्रतिकृति के बाद विपरीत गुणसूत्र द्वारा इस अंतर को भरा जा सकता है, लेकिन सेलुलर विभाजन होने से पहले। इस प्रक्रिया को समरूप पुनर्संयोजन के रूप में जाना जाता है और इसमें प्रकाश की आवश्यकता नहीं होती है।
एक्सिशन रिपेयर तब होता है जब क्रॉस-लिंक्ड बेस-पेयर्स को एक प्रोटीन कॉम्प्लेक्स द्वारा पहचाना जाता है जो क्रॉस-लिंक से पहले और बाद में फैले कई बेस को हटा देता है। हटाने के बाद, डीएनए को टेम्पलेट के रूप में गैर-विकृत स्ट्रैंड का उपयोग करके सही ढंग से दोहराया जाता है।