जीवाश्मों को उनकी संरक्षण प्रक्रिया के आधार पर पाँच प्रकारों में वर्गीकृत किया जा सकता है। जब कोई जीव तलछट से दब जाता है, तो तलछट को चट्टान में बदलने पर वह एक जीवाश्म छोड़ सकता है। जीवों द्वारा चट्टान में छोड़े गए छाप जीव से ऊतक और कंकाल जैसी मूल सामग्री नहीं हैं। भूगर्भिक समय में कार्बनिक पदार्थ को प्रतिस्थापित, रूपांतरित या भंग कर दिया जाता है।
परमिनरलाइज़ेशन
किसी जीव के दबने के बाद, खाली जगहों पर भूजल द्वारा आक्रमण किया जा सकता है। यदि पानी खनिजों में समृद्ध है, तो वे जीव के समान आकार में अवक्षेपित या क्रिस्टलीकृत हो जाएंगे। क्रिस्टल जीव को भरते हैं और प्रतिस्थापित करते हैं, जो घुल जाता है। यदि जीव धीरे-धीरे सड़ता है, तो अधिक क्रिस्टल बन सकते हैं, जो उच्च स्तर का विवरण प्रदान करते हैं।
मोल्ड और कास्ट
अक्सर, समय के साथ विघटन या क्षय द्वारा जीव पूरी तरह से हटा दिया जाता है। जीव के गायब होने पर बनी गुहाएं तलछट से भर सकती हैं। एक बार जीव चले जाने के बाद, चट्टान में केवल एक छाप रह जाती है। यदि कोई जीवाश्म किसी जीव के बाहर की नकारात्मक छाप है, तो एक साँचा बनता है। यदि जीव तलछट से भर जाता है, तो यह एक डाली है।
recrystallization
यदि कार्बनिक पदार्थ को हटाया नहीं जाता है, तो इसे जीवाश्म का हिस्सा बनने के लिए बदला जा सकता है। तलछट के भीतर दफनाने से गर्मी और दबाव जीव से मूल सामग्री की संरचना को बदल सकता है। हड्डियों में कैल्शियम कैल्साइट या अर्गोनाइट में पुन: क्रिस्टलीकृत हो सकता है। एक जीव में यौगिकों को पुन: क्रिस्टलीकृत किया जाता है जो नए खनिजों को बनाने के लिए पुनर्व्यवस्थित होते हैं। पुन: क्रिस्टलीकरण अक्सर हड्डियों या कैल्शियम में उच्च गोले में होता है।
अथ जलकर कोयला हो जाना
जीवित चीजों में बड़ी मात्रा में कार्बन होता है। जब उन्हें दफनाया और संकुचित किया जाता है, तो वे मूल जीव के गहरे काले रंग के सांचे में बदल सकते हैं। तीव्र गर्मी और दबाव जीवाश्म को कुचल देते हैं और उसे विकृत कर देते हैं। पर्याप्त ताप और दबाव से कोयला बनता है। पौधे की पत्ती के जीवाश्म बिना विकृत लेकिन कार्बोनेटेड पाए जाते हैं क्योंकि वे सपाट होते हैं और द्वि-आयामी होते हैं। सामग्री को कार्बोनाइजेशन द्वारा हटाया नहीं जाता है, लेकिन बदल दिया जाता है।
बायोइम्यूरेशन
जीवन रूप कभी-कभी एक दूसरे पर बढ़ते हैं। मूंगा जैसे समुद्री जीवन आपस में जुड़ी हुई संरचनाएं बनाते हैं जो अक्सर मूंगा या समुद्री स्पंज के अन्य टुकड़ों का उपभोग या घेर लेते हैं। कोरल के जीवाश्म अवशेषों के भीतर मोल्ड या गुहाओं को पीछे छोड़ा जा सकता है, जो स्वयं अलग जीवाश्म हैं। एक कठोर खोल के बिना एक जीव अपने आसपास के बड़े जीव में खाली जगह छोड़ देगा।