La microbiologie est l'étude des micro-organismes: des formes de vie unicellulaires microscopiques ou à peine visibles telles que bactéries, archées, protozoaires et certains champignons, et même de très petites plantes multicellulaires, animaux et champignons. Les microbiologistes étudient également des phénomènes non-organismes réalistes tels que les virus, les prions, les viroïdes et les virions. "Microbe" est un terme fourre-tout pour toutes ces entités. Le dénombrement en microbiologie est la détermination du nombre de microbes viables individuels dans un échantillon; quatre techniques de base sont possibles.
Compter les cultures
Une mesure directe pour le dénombrement microbien est la numération sur plaque standard, également appelée numération viable. Pour ce comptage, vous cultivez un échantillon en le diluant, en le plaçant sur des plaques de milieu de culture et en les incubant pendant une durée déterminée. Vous comptez ensuite le nombre de colonies et utilisez ce nombre pour déduire le nombre initial de microbes dans l'échantillon. Techniquement parlant, une numération sur plaque ne donne pas le nombre de microbes individuels, mais plutôt le nombre de "colonies formant unités », car vous ne pouvez pas savoir avec certitude si chaque colonie provient réellement d'un seul microbe ou d'un petit groupe de microbes. Cependant, ces comptages sont considérés comme très précis pour estimer le nombre de microbes dans les échantillons originaux. Les inconvénients sont que ce test prend du temps et de l'espace et nécessite un équipement spécialisé qui doit être préparé correctement.
Comptages individuels
Les dénombrements microscopiques directs, également appelés dénombrements cellulaires totaux, sont une autre forme de dénombrement direct. D'abord, vous divisez un échantillon en un certain nombre de chambres de taille égale. Ensuite, vous déterminez le nombre moyen de microbes par chambre en comptant certains ou tous au microscope. Enfin, vous utilisez cette moyenne pour calculer le nombre dans l'unité d'origine. Le principal inconvénient des comptages microscopiques directs est qu'il est difficile de distinguer les microbes vivants des morts, de sorte que cette méthode peut ne pas donner un dénombrement fiable et précis.
Rayons de lumière, nuages de microbes
Les tests de turbidité sont des formes de dénombrement indirect. La turbidité est la turbidité d'un liquide. En mesure turbidimétrique, vous mettez un échantillon en solution, mesurez la nébulosité de la nouvelle solution en y projetant de la lumière avec un spectrophotomètre, puis estimer le nombre de microbes vivants qu'il faudrait pour produire le niveau de nébulosité observé. L'inconvénient ici est que quelqu'un doit avoir déjà effectué de nombreux comptages sur plaque standard du microbe en question dans afin de préparer des solutions d'échantillons de turbidité variable, afin que vous disposiez d'un étalon pour mesurer votre échantillon actuel contre. Vous devez également faire attention à ne pas trop concentrer votre échantillon, car un comptage turbidimétrique n'est précis que si aucun microbe de l'échantillon n'en bloque les autres. Dans une comparaison de turbidité visuelle, vous comparez la turbidité de votre échantillon avec la turbidité d'une unité de même taille et de nombre microbien connu, et estimez un dénombrement basé sur cette comparaison.
Résultats indirects
Deux autres formes de dénombrement indirect sont la détermination de la masse et la mesure de l'activité microbienne. Pour un dénombrement de détermination de masse, vous pesez la quantité de matière biologique dans votre échantillon, comparez cette poids à une courbe standard pour les comptes microbiens connus et estimer le nombre microbien d'origine à partir de ce Comparaison. Pour une mesure d'activité microbienne, vous mesurez la quantité d'un produit biologique dans votre échantillon, tel que déchets métaboliques, puis comparez-les à une courbe standard pour les dénombrements connus et estimez votre dénombrement à partir de ces Comparaison.