Un arbre phylogénétique est une représentation graphique des relations évolutives qui montre comment les organismes pourraient avoir divergé d'un ancêtre commun. Auparavant, cela se faisait par comparaison de l'anatomie et de la physiologie d'organismes vivants et de fossiles, mais maintenant, l'information génétique tirée des séquences nucléotidiques de l'ADN est couramment utilisée. Les organismes avec peu de similitudes peuvent être trouvés sur les "branches" séparées d'un arbre phylogénétique et ceux avec des points communs spécifiques seraient situés sur les "brindilles" de la même branche. Un arbre phylogénétique est une méthode pour comprendre les espèces et les changements évolutifs des organismes.
Sélectionnez un organisme modèle pour la comparaison des relations. Cela peut être fait avec une espèce, une race ou une séquence nucléotidique qui représente un organisme. Un exemple d'organisme pourrait être une vache. Le reste de l'arbre démontrerait à quel point une vache est étroitement liée à d'autres organismes sur la base de traits génétiques.
Choisissez un groupe externe. Un groupe externe est un organisme moins étroitement apparenté ou une séquence nucléotidique très différente. Si l'organisme modèle est une vache, alors un sous-groupe possible serait un poisson. Plus les deux organismes sont différents, plus leur point de ramification divergent sur l'arbre phylogénétique sera bas. L'heure est représentée avec la date la plus ancienne en bas du graphique et le jour actuel en haut du graphique. Le placement des branches montre approximativement quand, dans le passé, un trait évolutif a peut-être changé un organisme ancestral en différentes espèces.
Déterminez un ensemble de caractéristiques à utiliser pour la comparaison. Les exemples incluent « a quatre pattes », « mâche le ruminant », « donne vie à la naissance » ou « fait pousser les cheveux ». Les séquences nucléotidiques sont juste représentations alphabétiques de l'ADN qui détermine les caractéristiques, donc une autre option serait: "contient la séquence ATGGACACGGA."
Divisez les organismes en fonction des caractéristiques. Lorsqu'un organisme ne contient pas le caractère souhaité, une branche est créée dans l'arbre phylogénétique. Pour la caractéristique « a quatre pattes », les vaches, les moutons et les cerfs seraient tous sur une branche, tandis que les poissons seraient sur une branche séparée. Collez l'image ou la séquence d'une vache dans le coin supérieur du panneau d'affichage et du poisson dans le coin opposé et tracez deux lignes à partir d'elles jusqu'à la base du papier en forme de V qui se croisent.
Continuez à séparer les organismes modèles ou les séquences nucléotidiques jusqu'à ce que chaque exemple ait une seule séparation de la branche en une brindille. La caractéristique « a de la laine » séparerait les moutons des cerfs et des vaches sur une seule branche. Placez l'image du mouton près de l'image du poisson et tracez une ligne qui se connecte en forme de V jusqu'à la branche de la vache. L'utilisation de la caractéristique « a la queue duveteuse » permettrait de distinguer la vache du cerf. Collez l'image du cerf entre la vache et le mouton et tracez une autre ligne en forme de V qui se coupe au-dessus des lignes de poisson et de mouton. Lorsque chaque espèce a une seule branche, l'arbre phylogénétique est complété.