Comment calculer le point isoélectrique des peptides

Les peptides sont de courts fragments polymères composés d'acides aminés. Chaque peptide a une certaine séquence d'acides aminés désignée par un code à trois lettres ou à une lettre; par exemple, l'acide aminé alanine est abrégé en « Ala » ou « A ». La charge des peptides dans la solution dépend de l'acidité de la solution. Le point isoélectrique (pI) fait référence à la valeur d'acidité de la solution à laquelle la molécule de peptide a une charge nette de zéro. La solubilité du peptide est minimale au point isoélectrique. Utilisez les serveurs Web disponibles pour calculer la valeur pI d'une séquence d'acides aminés peptidiques.

Écrivez la séquence peptidique en utilisant le code à une lettre. Par exemple, si un peptide a une séquence d'acides aminés Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanine-Serin-Glumatic acid-Leucine-Proline), alors la séquence d'une lettre est "ASELP". Si nécessaire, consultez le tableau de conversion de trois lettres à une lettre donné dans Ressources.

Utilisez n'importe quel navigateur Web, Internet Explorer ou Firefox, par exemple, pour accéder à un serveur qui calcule le point isoélectrique du peptide (pI); voir Ressources.

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Lisez la valeur du point isoélectrique (pI) indiquée dans la ligne « pI théorique/Mw ». Dans notre exemple, le pI est de 4,00. Notez que le serveur calcule également le poids moléculaire (Mw) du peptide.

A propos de l'auteur

Oxana Fox est une rédactrice indépendante spécialisée dans la médecine et le traitement, les logiciels et le matériel informatique, la photographie numérique et les services financiers. Elle est diplômée du Moscow Medical College en 1988 avec une formation formelle en pédiatrie.

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