Les relations entre les différents animaux sont établies par taxonomie. La taxonomie est la classification des êtres vivants. Ces classifications sont ventilées comme suit, du plus grand groupe à une espèce animale individuelle: Royaume, embranchement, sous embranchement, classe, ordre, famille, genre, espèce. Les animaux qui sont dans la même espèce sont très étroitement liés, et les animaux du même royaume sont très éloignés. Par exemple, tous les animaux font partie d'un même royaume, Animalia, et toutes les plantes appartiennent au royaume Plantea.
Toutes les araignées et tous les crabes appartiennent au phylum Arthopodia, de même que tous les insectes. Les arthropodes se distinguent physiquement par le fait qu'ils ont tous des pattes segmentées et articulées et un exosquelette. Bien que les crabes et les araignées soient regroupés dans le même phylum, cela ne signifie pas qu'ils sont nécessairement étroitement liés. Par exemple, tous les animaux avec une colonne vertébrale sont dans le phylum Cordata. Mais il est clair que bien que les poissons et les singes aient tous deux des épines, ils sont très différents.
La division entre les araignées et la plupart des crabes se produit au niveau du sous-embranchement. Les araignées appartiennent au sous-embranchement Cheilcerata, tandis que la plupart des crabes appartiennent au sous-embranchement Mandibulata. La différence est en grande partie que les crabes ont une mandibule, un type de mâchoire, et que les araignées ont des chélicères, qui sont des pièces buccales qui apparaissent avant la bouche. Les "crocs" des araignées sont les chélicères.
Les limules sont dans le même sous-embranchement que les araignées, Cheilcerata. Cela rend les limules plus étroitement liés aux araignées qu'ils ne le sont même aux autres crabes. Comme les araignées, les limules n'ont pas de mandibule et ont plutôt des chélicères devant leurs pièces buccales. Les araignées et les limules sont répartis au niveau de la classe. Les araignées appartiennent à la classe Arachnida, tandis que les limules appartiennent à la classe Merostomata.
Une autre créature ressemblant à un crabe existait et est également classée dans le sous-embranchement Cheilcerata. On les appelle « scorpions de mer ». Ils se sont éteints il y a environ 250 millions d'années. Ces «scorpions» avaient un dard plus gros à l'arrière de leur queue et mesuraient plus de 6 pieds de long. Cela en fait probablement le plus grand arthropode qui ait jamais vécu. Leur inclusion dans le sous-embranchement Cheilcerata rend ces anciens scorpions ressemblant à des crabes également plus étroitement liés aux araignées qu'aux crabes.
