Ennen mikroskooppien keksimistä maailmassa uskottiin olevan vain kaksi valtakuntaa, kasveja ja eläimiä. Teknologian kehityksen ja mikroskoopin keksinnön ansiosta luokitusjärjestelmä koostuu nyt kuudesta valtakunnasta: protista, animilia, arkkibakteerit, plantae, eubakteerit ja sienet. Maanpäälliset organismit asuvat eri elinympäristöissä hyvin happamasta ympäristöstä maanpäälliseen ympäristöön.
Protista-elinympäristö
Kaikki mikroskooppiset organismit, jotka eivät kuulu mihinkään muusta viidestä valtakunnasta, ovat osa protista-perhettä. Tähän sisältyvät euglena, plasmodium ja ameoba. Nämä organismit ovat vesieliöitä, ja niitä esiintyy sekä makeassa että suolaisessa vedessä, mukaan lukien valtameret, järvet, lammet, purot ja muut vesimuodostumat.
Animalia-elinympäristö
Animalia-valtakunta on suurin valtakunta, joka koostuu yli miljoonasta lajista. Sieni, plankton, hyönteiset, hämähäkit, ihmiset ja valaat muiden eläinten joukossa ovat tämän valtakunnan olentoja ja asuvat käytännössä kaikkialla. Tämä pätee pohjois- ja etelänavalle, valtamerille, järville ja kiviselle maastolle kaikkialla maailmassa.
Archaebacteria Habitat
Arkkibakteerit löydettiin ensimmäisen kerran Yellowstonen kansallispuiston kuumista lähteistä. Valtakunta koostuu halofiileistä ja metanogeeneista muiden organismien joukossa. Kukinta alueilla, joilla ei ole happea, korkeilla suolapitoisuuksilla, korkeilla happamuusalueilla ja kuumilla lähteillä, arkkibakteerien elinympäristö on lievästi sanottuna äärimmäinen. Teorian mukaan arkkibakteerit voivat olla vanhin organismi, joka on koskaan kolonisoinut maapallolla niiden äärimmäisten olosuhteiden vuoksi, joissa ne menestyvät.
Plantae-elinympäristö
Suurimmalle osalle meistä on tuttu plantae-valtakunta, joka koostuu puista, pensaista, viiniköynnöksistä, kukkivista kasveista, saniaisista ja sammalista muiden elävien organismien joukossa. Monet kasvit ovat vesipitoisia, mikä tarkoittaa, että ne selviävät ja menestyvät vedessä, olipa kyse sitten tuoreesta tai suolaisesta vedestä. Valtaosa kasveista asuu tosiasiallisesti maan päällä.
Eubakteerien elinympäristö
Eubakteerit ovat olleet maan päällä melkein yhtä kauan kuin arkkibakteerit. Käsiäsi pestessä yrität yleensä päästä eroon tämäntyyppisistä bakteereista, joita kutsumme usein "bakteereiksi". Vaikka suurin osa eubakteereista on hyödyllisiä, jotkut kuten Streptococci ja Esherischia coli (E. coli) ovat haitallisia ihmisten terveydelle. Eubakteereja esiintyy kaikkialla planeetalla. Imperial College London -tutkijoiden mukaan suurin osa ihmiskehon soluista on bakteereja.
Sienien elinympäristö
Sienet, homeet, hiivat ja hometta ovat kaikki sienimuotoja. Koska sienet ruokkivat kuolleita orgaanisia aineita, paras paikka niiden löytämiseen ovat metsät ja niityt, vaikka sieniä löytyy melkein kaikkialla maailmassa, mukaan lukien valtameret, järvet, maan maanpinta ja jopa mikroskooppiset rakot sähköisessä muodossa laitteet. Jotkut sienityypit kasvavat sekä ihmisten että eläinten ulosteissa.