Tutkijoilla on kyky sekvensoida DNA-molekyyli; toisin sanoen, he voivat määrittää nukleotidiemästen järjestyksen missä tahansa molekyylissä. DNA-molekyylin sekvensointi voi olla ensimmäinen monista tarvittavista vaiheista sen selvittämiseksi, kuinka spesifinen DNA - molekyylin nukleotidit ovat vuorovaikutuksessa keskenään ja koodaavat eri ominaisuuksia organismi. DNA: n sekvensointiprosessi on pikemminkin mukana, mutta automaattiset DNA-sekvensoijat minimoivat tarvittavan ihmisen osallistumisen ainakin osan prosessista.
Näytteen valmistus
Jotta automaattinen DNA-sekvensseri toimisi, sen on löydettävä neljä DNA-muodostavaa nukleotidiemästä: adeniini, guaniini, tymiini ja sytosiini. Tutkijat kopioivat osan DNA: sta monta kertaa ja käyttävät restriktioentsyymejä leikkaamaan DNA: n erikokoisiksi paloiksi. Sitten ne lisäävät pienen määrän fluoresoivaa leimattua emästä kuhunkin DNA-erään. Emäs, joka on joko adeniini, tymiini, guaniini tai sytosiini, sitoutuu emäskomplementtiinsa juosteen päässä. Esimerkiksi adeniini sitoutuu timiiniin päättyviin säikeisiin ja guaniini sitoutuu sytosiiniin päättyviin säikeisiin.
Automaattinen DNA-sekvensseri
Automaattinen DNA-sekvensseri on rakennettu aivan kuten DNA-sekvensseri, joka vaatii enemmän manuaalista työtä. Tarkemmin sanottuna automaattinen DNA-sekvensseri on noin 1 jalan pituinen säiliö, jossa on 96 geelikaivoa, joihin DNA voidaan kaataa. Automaattisessa DNA-sekvenssissä, kuten missä tahansa DNA-sekvensserisessä, DNA injektoidaan säiliön yläosassa oleviin geelikaivoihin ja negatiivinen varaus syötetään säiliön siihen päähän. Negatiivinen varaus antaa voimakkaan sysäyksen DNA-säikeille matkustaa eri etäisyyksillä säiliön päähän.
Automaattinen ruiskutus
Automaattinen DNA-sekvensseri injektoi DNA-erät automaattisesti geelin yläosaan. Sellaisena se säästää tutkijoita valtavasti aikaa ja vaivaa. Kun panokset on ruiskutettu, sekvensseri lisää negatiivisen varauksen säiliön toiseen päähän aiheuttaen säikeiden liikkuvan vaihtelevilla etäisyyksillä geelin läpi. Eri etäisyydet heijastavat geelin läpi kulkevien DNA-säikeiden eri kokoja.
Ilmaisin
Monet automaattiset DNA-sekvensointikoneet on perustettu havaitsemaan fluoresoiva väriaine geelin läpi kulkevissa DNA-säikeissä. Tällöin he voivat tunnistaa säikeiden päissä olevat nukleotidit ja tallentaa ne tietokoneeseen. Sekvenssereillä on kuitenkin parhaimmillaan sekoitettu versio DNA-nukleotideista. Kun olet käyttänyt automaattista DNA-sekvensointilaitetta, sinun on suoritettava prosessi, jota kutsutaan "viimeistelyksi", jossa tietokoneiden yhdistelmä ja tutkijat lajittelevat DNA-juosteen havaitsemisen tulokset koottaakseen tiedot kattavaksi kuvaukseksi DNA: sta säie. Ei ole yllättävää, että tämä prosessi voi kestää paljon kauemmin kuin varsinainen sekvensointiprosessi.