Erilaisia ekspressiojärjestelmiä on kehitetty tänään, ja ne ovat kaupallisesti hyvin vakiintuneita, erityisesti rekombinanttiproteiinien saamiseksi. Käytetyt ilmentämisjärjestelmät sisältävät nisäkäs- ja hyönteisviljelmät, Escherichia coli ja bakteerit. Ilme basillissa on näkyvä järjestelmä, jota käytetään. Ferdinand Cohn kuvasi ensimmäisenä Bacillus-suvun vuonna 1872, ja niihin sisältyy suuri määrä gram-positiiviset bakteerilajit, kuten Bacillus subtilis, Bacillus anthracis, Bacillus megaterium ja Basilli.
Bacillus Subtilis
Bacillus subtilis on gramma-positiivinen bakteeri, jota esiintyy yleisesti maaperässä, ja se sisältää vain yhden kalvon, mikä tekee siitä ihanteellisen kehyksen orgaanisten molekyylien eritykselle. Bacillus subtilis on houkutteleva isäntä proteiinin tuotannolle, koska sillä on kyky erittää solunulkoisia entsyymejä suoraan elatusaineeseen. Sillä on myös suuri erittymiskyky. Bacillus subtilista on käytetty parantamaan erittyvien vieraiden proteiinien, kuten interferonin, kasvuhormonin, pepsinogeenin ja epidermaalisen kasvutekijän, laatua ja määrää. Kuitenkin B. subtilis tuottaa ja erittää suuria määriä solunulkoisia proteaaseja, jotka hajottavat erittyviä vieraita proteiineja. Bacilluksesta puuttuu myös hyvin säädeltyjä indusoituvia vektoreita, mikä rajoittaa B: n laajaa käyttöä. subtilis-järjestelmä.
Bacillus Anthracis
Bacillus anthracis on gram-positiivinen itiöitä muodostava bakteeri, joka asuu maaperässä. Saapuessaan ihmisen isäntään se voi nopeasti lisääntyä ja aiheuttaa pernaruttoa, sairautta, johon liittyy tovemiaa ja septikemiaa. Esimerkki Bacillus anthraciksen kielteisistä vaikutuksista oli sen mahdollinen käyttö biologisessa sodankäynnissä, kuten Yhdysvaltojen postijärjestelmä osoitti vuonna 2001. Kapselin määrittävä geeni ja pernarutosta vastaavat toksiset tekijät sijaitsevat kahdessa plasmidissa, pXO1 ja pXO2 ja näiden geenien transkriptio aktivoituu säätelijä AtxA: lla vegetatiivisen ajan kertolasku. Bacillus anthracis -tutkimukset ovat keskittyneet ensisijaisesti geenien ilmentymiseen, joka liittyy vakiintuneimpaan virulenssitekijään, suoja-antigeeneistä (PA) koostuvaan pernaruttotoksiiniin. Bacillus anthracisin suojaantigeeni on tärkein suojaava immunogeeni nykyisessä humaanirokotteessa.
Bacillus Megaterium
Bacillus megaterium on yksi suurimmista maaperässä esiintyvistä basileista. Sitä esiintyy monissa ekologisissa kapealla, koska se kasvaa monenlaisissa hiilivarastoissa. B. megateriumin ilmentämisjärjestelmä tarjoaa joustavan ja helppokäyttöisen työkalun vakaan ja korkean tuoton proteiinituotantoon. Tämä johtuu useista syistä; ensin B. megateriumissa ei ole emäksisiä proteaaseja, mikä mahdollistaisi sen olevan hyvä kloonaus ja vieraiden proteiinien ilmentyminen hajoamatta. Toiseksi bakteeri erittää proteiineja helposti kasvualustaan ja kolmanneksi, soluseinästä ei löydy endotoksiineja. Se tuottaa erilaisia entsyymejä, kuten amylaasia, jota käytetään leipoteollisuudessa, ja penisilliiniamidaasia, jota käytetään antibioottien valmistamiseen.
Bacillus Brevis
Bacillus brevis -bakteeria on käytetty menestyksekkäästi tuottamaan heterologisia proteiineja (proteiineja, jotka eroavat rakenteestaan). Bacillus brevis -bakteerista ei ole tehty paljon tutkimuksia, mutta sen tiedetään tuottavan liukoisia proteiineja, jotka ovat liukenemattomia E. coli-järjestelmä. Se on myös turvallinen isäntä, jota on helppo kasvattaa ja steriloida. Suurin haitta, joka rajoittaa sen käyttöä, on vähäinen proteiinisato.