Monimuotoisuus voi tarkoittaa monia asioita. Ekosysteemissä monimuotoisuus voi viitata läsnä olevien erilaisten lajien tai ekologisten markkinarakojen määrään. Laajentamalla asioita alueella voi olla erilaisia ekosysteemejä. Jos siirrymme alas lajien tasolle, geneettinen monimuotoisuus tarkoittaa sitä, kuinka paljon geneettistä vaihtelua populaatiossa on. Geneettinen monimuotoisuus on tärkeää, koska mitä enemmän geenejä on populaatiossa, sitä todennäköisemmin yksi näistä geeneistä on hyödyllinen uhkien, kuten ilmastonmuutoksen tai uuden taudin, kohdalla. Geneettinen monimuotoisuus liittyy lajin kykyyn sopeutua muuttuvaan ympäristöön.
Kotimaiset koirat
Ihmiset ovat luoneet erilliset koirarodut lajin sisällä kasvattamalla valikoivasti yksilöitä, joilla on haluamiaan piirteitä. Geneettinen vaihtelu näiden rotujen sisällä on vähentynyt, koska niiden efektiivinen populaatiokoko on rajoitettu ihmisillä, jotka valvovat pääsyä kavereihin. Rotujen geneettinen vaihtelu on kuitenkin lisääntynyt, kun eri rodut eroavat toisistaan. Nettovaikutus on populaatio, jolla on enemmän geneettistä monimuotoisuutta kuin heidän lähimpään villiin serkkunsa, susi (katso viite 1).
Woody-kasvilaji
Puumaisilla kasveilla, kuten puilla, on yleensä enemmän geneettistä monimuotoisuutta kuin verisuonikasveilla, kuten nurmilla. Tämä pätee sekä populaatioissa että eri lajeissa. Osa monimuotoisuudesta johtuu kunkin lajin maantieteellisen alueen koosta ja siitä, kuinka pitkälle ne voivat siirtää geneettisiä tietojaan esimerkiksi tuulen pölyttämisen tai eläinten siementen levittäjien kautta. Suuri osa puumaisten kasvien monimuotoisuudesta on kuitenkin edelleen mysteeri, ja se on todennäköisesti sidoksissa yksittäisten lajien evoluutiohistoriaan (ks. Viite 3).
Generalist vs. Erikoislajit
Generalistit ovat hyvin sopeutuvia lajeja, jotka pystyvät mukauttamaan käyttäytymisensä ja ruokavalionsa muuttuvaan ympäristöön. Kojootit ovat esimerkki yleisestä lajista. Erikoislajeille on kehitetty hyvin erityisiä piirteitä, jotka antavat heille mahdollisuuden hyödyntää yhtä tiettyä resurssia. Kolibrit ovat esimerkki erikoistuneista lajeista. Vaihtelevammat ympäristöt suosivat yleensä yleisiä lajeja ja myös enemmän geneettistä monimuotoisuutta lajien sisällä. Vaikka on olemassa monia poikkeuksia, nyrkkisääntö voi olla, että generalisteilla on enemmän geneettisiä ominaisuuksia vaihtelevuus kuin asiantuntijoilla, osittain siksi, että heidän ympäristönsä vaativat enemmän sopeutumiskykyä (ks viite 4).
Gepardi
Geneettisen monimuotoisuuden tärkeyttä osoittavat esimerkit eivät aina tule monipuolisimmista lajeista. Gepardit kokivat geneettisen pullonkaulan noin 10000 vuotta sitten, jolloin heidän populaationsa väheni hyvin pieneen määrään ja loput eläimet siirtyivät kotieläimiin. Useimmat lajit vaihtelevat noin 20 prosentissa geeneistä, mutta gepardit vaihtelevat vain 1 prosentin. Alhainen geneettinen vaihtelu tekee heikentävistä ja jopa tappavista geneettisistä häiriöistä yleisempiä ja johtaa vähäiseen lisääntymismenestykseen. Jos gepardit selviävät lajina, voi kulua vuosituhansia, ennen kuin ne palauttavat täysin geneettisen monimuotoisuutensa (katso viite 2).