Havupuilla on kahdenlaisia käpyjä: siitepölykartio ja siemenkartio. Joillakin havupuilla on molemmat kartiotyypit samassa puussa, jolloin puu voi pölyttää itsensä. Ristipölytys tapahtuu, kun yksi puu tuottaa vain siemenkäpyjä, ja siksi se on lannoitettava siitepölyllä, joka kulkeutuu siemenkartioihin muiden lähellä olevien puiden siipikartioista.
Siipikartiot ovat tyypillisesti pienempiä ja leveämpiä kuin siemenkäpyjä. Siipikartiot pyrkivät minne ja kuolevat, kun kartioissa oleva siitepöly on vapautettu siemenkartioiden lannoittamiseksi. Lepotilassa havupuu voi olla uros, naaras tai kasvullinen. Ero silmutyyppien välillä tässä vaiheessa on mahdollista vain leikkaamalla. Yksi vihje, joka voi auttaa siitepölyn kartion tunnistamisessa, on sen sijainti. Siemenkäpyjä on taipumus kehittyä korkeammalle puuhun leviämisen helpottamiseksi siementen pölyttämisen jälkeen.
Siemenkäpyjä käytetään yleisesti puun tyypin tunnistamiseen, koska ne pysyvät puun päällä tai alla pidempään. Kapeat siemenkartion silmut turpoavat neljästä kuuteen viikkoon, kunnes punaiset tai vihreät kärjet ovuliferaaliset asteikot alkavat näkyä. Vaa'at pyrkivät taittumaan pystysuoraan kartion pohjasta ja putoavat sitten alaspäin, kun ne ovat hyväksyneet siitepölyn siitepölystä, siementen kehityksen ja signaalin kartion kypsyyden aloittamiseksi.
Joillakin havupuilla ei ole siitepölyä eikä siemenkäpyjä. Sen sijaan puu tuottaa hedelmää, joka peittää siemenet osittain. Kanadalainen marjakuusi on esimerkki arilia tuottavasta havupuusta, joka sisältää mehevän päällysteen, joka sisältää puun siemenet. Eläinten ja lintujen saalistajien, jotka saattavat haluta ruokkia ruohoa, siementen häviämisen estämiseksi marjakuusi hedelmä, tämä puu on sopeutunut niin, että sen hedelmät ovat myrkyllisiä ja siemenet ovat jäljellä rauhassa.
Kartiota sisältävät havupuut tai pinophyta luokitellaan gymnospermeiksi (paljain siemeniksi), koska niiden munasolut ja siemenet eivät ole suljettuina munasarjoihin eivätkä löydy hedelmien suojapeitteistä. Jos havupuussa on samassa puussa sekä siitepölyä että siemenkäpyjä, se luokitellaan edelleen diploidiseksi sporofyytiksi. Kun siemenet ovat muodostuneet pölytyksen tapahtuessa, kartion vaa'at avautuvat vapauttamaan siemenet dispergoimiseksi veteen, tuuleen ja ihmisen ja eläinten liikkeeseen.
