Isomeerit ovat kemikaaleja, joilla on saman tyyppiset ja määrät erilaisia atomeja ja jotka ovat kuitenkin erilaisia yhdisteitä. Yksi isomeerityyppi on rakenteellinen isomeeri, jossa samat atomit ovat kytkeytyneet eri tavoin erilaisten molekyylien muodostamiseksi. Esimerkiksi kaksi hiiltä, kuusi vetyä ja yksi happi voitaisiin järjestää dietyylieetterin (CH3OCH3) tai etanolin (CH3CH2OH) muodostamiseksi. Kaavassa C6H12 löydetyt kuusi hiiltä ja 12 vetyä voidaan järjestää muodostamaan yllättävät 25 erilaista rakenteellista isomeeriä.
Piirrä yksi mahdollinen kuuden hiilen rengasrakenne: sykloheksaani. Tämä rakenne piirretään liittämällä kuusi hiiltä seuraavaksi ympyrässä, jotta ne muodostavat renkaan. Piirrä kaksi vetyä jokaiseen hiileen.
Piirrä yksi mahdollinen substituoitu viiden hiilen rengasrakenne: metyylisyklopentaani. Tämä rakenne piirretään liittämällä viisi hiiltä renkaaseen. Vedä jäljellä oleva hiili, jossa on kolme vetyä (toisin sanoen "metyyliryhmä CH3-), kiinnittyneenä mihin tahansa renkaan hiileen.
Piirrä neljä mahdollista substituoitua nelihiilistä rengasrakennetta: 1,1-dimetyylisyklobutaani, 1,2-dimetyylisyklobutaani, 1,3-dimetyylisyklobutaani ja etyylisyklobutaani. Nämä rakenteet piirretään vetämällä neljä hiiltä renkaaseen. Kaksi CH3-ryhmää on liitetty hiileen hiilen (numeroiden) kohdalle niiden numeroiden kohdalla, jotka näkyvät nimen alussa. Mikä tahansa renkaan hiili voidaan valita numeroksi 1, kaksi hiiltä olisi sen vieressä. Jatka mallineuletta, kunnes kaikki neljä hiiltä ovat valmiit. Poikkeuksena on etyylisyklobutaani, jonka "etyyliryhmä CH3CH2- on kiinnittynyt mihin tahansa renkaan hiileen.
Piirrä kuusi mahdollista substituoitua kolmen hiilen rengasrakennetta: 1,2,3-trimetyylisyklopropaani, 1,1,2-trimetyylisyklopropaani, 1-etyyli-1-metyylisyklopropaani, 1-etyyli-2-metyylisyklopropaani, propyylisyklopropaani ja isopropyylisyklopropaani. Nämä rakenteet piirretään vetämällä kolme hiiltä renkaaseen. Kuten aikaisemmin, sopivat ryhmät kiinnitetään sopiviin hiileen renkaan ympäri numeroituna. Piirretään CH3-ryhmä, jossa metyylia esiintyy nimessä, CH3CH2-ryhmä, kun etyyliä löytyy, CH3CH2CH2- propyylille ja (CH3) 2CH2- isopropyylille.
Piirretään neljä lineaarista nelihiilirakennetta, jotka sisältävät yhden kaksoissidoksen: 2-etyyli-1-buteeni [CH2 = C (CH2CH3) CHCH2CH3], 2,3-dimetyyli-2-buteeni [CH3C (CH3) = C (CH3) CH2CH3], 2,3-dimetyyli-1-buteeni [CH2 = C (CH3) CH (CH3) CH3] ja 3,3-dimetyyli -1-buteeni [CH2 = CHC (CH3) (CH3) CH2CH3].
Piirrä kuusi lineaarista viiden hiilen rakennetta, jotka sisältävät yhden kaksoissidoksen: 2-metyyli-1-penteeni [CH2 = C (CH3) CH2CH2CH3], 3-metyyli-1-penteeni [CH2 = CHCH (CH3) CH2CH3], 4-metyyli-1-penteeni [CH2 = CHCH2CH (CH3) CH3], 2-metyyli-2-penteeni [CH3C (CH3) = CHCH2CH3], 3-metyyli-2-penteeni [CH3CH = C (CH3) CH2CH3] ja 4-metyyli-2-penteeni [CH3CH = CHCH (CH3) CH3].
Piirrä kolme lineaarista kuusihiilirakennetta, jotka sisältävät yhden kaksoissidoksen: 1-hekseeni [CH2 = CHCH2CH2CH2CH3], 2-hekseeni [CH3CH = CHCH2CH2CH3] ja 3-hekseeni [CH3CH2CH = CHCH2CH3].