Abiottinen piirre on ekosysteemin elämätön osa, joka vaikuttaa tapaan, jolla elävät olennot kukoistavat. Vesibiomeihin kuuluvat valtameri, järvet, joet, purot ja lampit. Mikä tahansa vesistö, jolla on elämää, on vesibioomi. Vesibiomeissa on monia abioottisia piirteitä, mutta ne ovat erityisen riippuvaisia viidestä näistä ominaisuuksista.
Auringonvalo
Auringonvalo on elintärkeää fotosynteesille, joka muodostaa perustan useimmille vesibiomien ravintoketjuille. Matalassa vedessä käytettävissä olevan auringonvalon määrä riippuu suurelta osin muuttuvista tekijöistä, kuten vuodenajasta, pilvisyydestä ja paikallisesta maantieteestä. Meriveden ja joidenkin järvien syvässä vedessä auringonvalo tunkeutuu kuitenkin vain murto-osaan tien pohjalle, jättäen valtavat vesilahjat täydelliseen pimeyteen. Suurin osa merestä ei saa ollenkaan auringonvaloa. Elämä näissä syvyydessä riippuu suurelta osin matalampien ekosysteemien uppoamista.
Lämpötila
Pienissä vesistöissä lämpötila voi vaihdella suuresti päivän ja yön välillä sekä vuodenajan mukaan. Organismien on oltava valmiita käsittelemään nämä vaihtelut tai kuolemaan. Suurissa järvissä ja syvissä valtamerissä lämpötila on syvyyden funktio. Kun auringonvalo vähenee syvyyden myötä, vesi kasvaa kylmemmäksi ja lämpötila riippuu vähemmän pintaolosuhteista. Syvällä meressä lämpötila laskee lähes jäätymiseen ja pysyy uskomattoman vakaana. Poikkeuksena ovat pienet ylikuumentuneen veden "saaret", joita tarjoavat merenpohjan tulivuoren tuuletusaukot, jotka kehittävät omat pitkälle erikoistuneet ekosysteeminsä.
Kemiallinen koostumus
Kaksi tärkeintä veteen liuotettua kemikaalia ovat happi ja hiilidioksidi. Happea tarvitaan eläinten ja joidenkin levämuotojen tukemiseen, kun taas hiilidioksidia tarvitaan kasvien elämän tukemiseen. Jos näiden kahden kemikaalin välinen tasapaino heitetään pois, tulos voi olla kasvien tai eläinten elämän massa. Veden kemialliseen koostumukseen vaikuttavat myös paikalliset maaperäolosuhteet ja ihmisen toiminnan valuminen. Joidenkin kemikaalien vähäinen nousu voi olla erittäin haitallista vesieliöille.
Maasto
Vedenalaisen maaston hyödyntämiseksi on kehittynyt hyvin erilaisia ekosysteemejä. Hitaalla, mutaisella pohjalla sijaitsevalla joella on täysin erilainen kalakanta kuin nopeasti ja selkeästi virtaava virta kallioiden yli. Meressä on erilaisia väestöjä, jotka ovat riippuvaisia koralliriutoista, hiekkarannoista, kallioisten saarien kiinnityksistä tai avoimen valtameren alueesta. Usein laji riippuu elinkaarensa aikana useammasta kuin yhdestä maastosta, vaikka jotkut ovat asiantuntijoita, jotka eivät voi selviytyä kapean maastoalueen ulkopuolella.
Veden häiriö
Vesihäiriöt voivat olla aaltojen, virtojen tai jokien liikkeitä. Häiriön määrä, johon vesimuodostuma kärsii, määrittää happesta ja hiilidioksidista liuenneen hapen määrän - ilmakehä, lämpötilan kerrostuminen pinnasta suurempaan syvyyteen ja ilmakehässä olevien kemikaalien vaikutukset vettä. Still-järvellä on kapeampi ja jäykemmin määritelty joukko lämpötilakerroksia kuin aallon lyömässä valtameressä, kun taas nopeasti virtaavan joen elämän vaatimukset eroavat molemmista.