Kuten useimmat maapallon biomit, savanniekosysteemi selviää herkässä tasapainossa ympäristötekijöiden ja erilaisten lajien, myös ihmisten, välillä. Vakava kuivuus voi ryöstää näiltä nurmikoilta heidän elävän vedensa ja lehdet, kun taas salametsästäjät ja alkuperäiskansat uhkaavat usein häiritä ruokaverkkoa tappamalla eläimiä urheilun tai urheilun vuoksi eloonjääminen.
Ihmistoiminta
Ihmisen toiminta voi vakavasti uhata häiritä savanniekosysteemejä. Kestämätön vedenkäyttö ja kastelumenetelmät voivat mahdollisesti kuivata elävöittävät joet ja vesireikät. Alueilla, joilla alkuperäiskansat sisällyttävät säännöllisesti bushmeat-villilihaa ruokavalioonsa, sorkka- ja kavioeläinten populaatiot ovat laskeneet huomattavasti. Jotkut savannien villieläimet metsästetään myös pokaaleina; Erityisesti mustia sarvikuonoja metsästetään arvokkaiden sarviensa vuoksi. Jopa jotkut kasvilajit ovat liian korjattu kaupallisen arvonsa vuoksi. Savannipuusta, afrikkalaisesta Blackwoodista valmistettuja kaiverruksia myydään usein turistimarkkinoilla.
Kuivuus ja raskas laiduntaminen
Pitkäaikaisella, vakavalla kuivuudella on vaarallinen vaikutus savanniekosysteemiin, ja laiduntamallit pahentavat tätä vaikutusta. Ankaran kuivuuden ja laiduntamisen yhdistelmä voi muuttaa ensisijaisesti syötävien, monivuotisten ruohojen nurmen savanniksi, jota hallitsevat syötävät ruohot ja kasvit. Kevyesti laidunnetut nurmialueet säilyttävät maistuvien, monivuotisten ruoholajien laadun, mutta kasvilajien koostumusta voitaisiin silti muuttaa. Asiantuntijat ovat vaatineet laiduntamisen ratkaisuja kuivuusjaksojen aikana vaikuttamaan mahdollisen muutoksen suuntaan nurmien kestävyyteen.
Aavikoituminen
Trooppiset savannit rajoittuvat usein kuivilla autiomailla, ja autiomaiden kaltaisten olosuhteiden leviämistä kuiville nurmialueille kutsutaan aavikoitumiseksi. Tämä savanin ekosysteemin uhka sisältää ilmastonmuutoksen, viljelykäytäntöjen, ylikarjatuksen, aggressiivinen maatalouden kastelu, joka laskee vesikerroksen tasoa pois kasvien juurista, metsien hävittämisestä ja eroosiota. Joka vuosi yli 46000 neliökilometriä afrikkalaista savanniä muuttuu autioksi. Kuivuutta kestävien kasvien istuttaminen voisi vakauttaa siirtyvät hiekkadyynit ja aloittaa lisäkasvillisuuden lisääntymisen.
Hiilidioksidipäästöt
Vuonna 2012 tehdyssä tutkimuksessa puumaisten kasvien massan suuri kasvu johtui "CO2-lannoitusvaikutuksesta". Kirjailijat oletetaan, että puumaisten kasvien kasvuvauhdin kasvu johtui ilmakehän hiilen lisääntymisestä dioksidi. Puiden ja pensaiden määrän dramaattinen kasvu voi uhata koko savanniekosysteemiä, koska nämä kasvit käyttävät enemmän vettä kuin ruoho. Namibian luonnonsuojelijat ovat raportoineet, että puumaiset kasvit ovat estäneet sekä antilooppia että gepardit, jotka metsästävät heitä - kehitys, jolla voi olla tuntemattomia vaikutuksia kaikkialla niityt.
