Siilit ovat Erinaceidae-perheen nisäkkäitä. Ne ovat alkeellisimpia edelleen elossa olevia nisäkkäitä, ja niillä ei ole juurikaan muutoksia viimeisten 15 miljoonan vuoden aikana. Fossiileja tutkimalla tutkijat ovat löytäneet joitain siilin primitiivisiä esi-isiä, mukaan lukien Litolestes, Leipsanolestes, Oncocherus, Cedrocherus ja Deinogalerix. Kemialliset analyysit ja fossiilisten luiden anatominen vertailu ovat auttaneet yhdistämään ne primitiivisiä eläimiä nykyaikaisille siileille, mutta jotkut heidän tottumuksistaan ja piirteistään ovat edelleen mysteeri tiede.
Litolestes ja Leipsanolestes
Litolestes on nykypäivän sienten vanhin tunnettu esi-isä. Se asui paleoseenikaudella, 65,5 - 56 miljoonaa vuotta sitten. Leipsanolestes on toinen saman ajanjakson suku, joka ruokki pääasiassa hyönteisiä. Molemmat suvut sisälsivät eläimiä, joiden koko oli samanlainen kuin elävillä siileillä. Näiden primitiivisten nisäkkäiden fossiileja löydettiin Montanasta ja Wyomingista.
Oncocherus
Oncocherus-suvun eläinten fossiilit ovat peräisin myöhäisestä paleoseenista Länsi-Kanadasta, noin 55,8-58,7 miljoonaa vuotta sitten. Oncorechuksella on joitain ominaisuuksia muiden Erinaceidae-perheen primitiivisten jäsenten kanssa: suurentuneet ylemmät ja alemmat premolaarit. Suvulla on kuitenkin suurempia premolaareja verrattuna Litolestes-fossiileihin. Oncocherus oli endeeminen nykypäivän Pohjois-Amerikassa.
Cedrocherus
Litolestesin ja Leipsanolestesin lisäksi Cedrocherus-suvun eläimet asuvat myös Pohjois-Amerikassa paleoseenikaudella, mutta todennäköisesti hampaat olivat pienempiä. Tutkija on löytänyt kaksi erillistä lajia: Cedrocherus ryani ja Cedrocherus aceratus. Näitä lajeja edustavien fossiilien kokoelma on hyvin rajallinen, riittää vain erottamaan suku Litolestesista ja Leipsanolestesta.
Deinogalerix
Muinaiskreikan kielen "kauhea siili" Deinogalerix oli endeeminen eläin, joka asui nykypäivän Italiassa myöhäisen mioseenin aikana, 11,6-5,3 miljoonaa vuotta sitten. Toisin kuin elävät siilit, deinogalerixilla oli hiukset eikä piikit peittäneet ruumiinsa. Deinogalerix oli 1 1/2 - 2 jalkaa pitkä, hänellä oli pitkä häntä ja kuono. Muiden primitiivisten Erinaceidae-jäsenten tavoin se ruokki hyönteisiä.
