Sijaitsee osittain Pohjois-Andien rannikolla sekä Tyynellämerellä että Karibianmerellä. Kolumbian ainutlaatuinen maantiede muodostaa viiden erittäin erottuvan ekosysteemin sen rajojen sisällä: Alppien tundra tai paramo; sademetsä; korkealla pilvimetsät; rannikkoalueet; ja tasangot - tai los llanos. Koska Kolumbia on niin lähellä päiväntasaajaa, se ei käy läpi merkittäviä kausivaihteluita.
Paramos
Paramot ovat korkealla trooppisia ekosysteemejä, jotka tiedeyhteisö on vasta alkamassa ymmärtää. Tutkimukset ovat osoittaneet, että nämä ainutlaatuiset ekosysteemit tuottavat uusia lajeja nopeammin kuin mikään muu ekosysteemi maapallolla. Kolumbian tuella asuu 68 hauraskasvilajia, kukkivia kasveja, jotka sieppaavat vettä ohimenevistä sumuista. Ekosysteemin jäkälän ja sammalen ohella frailejones suodattaa ja säätelee vettä, joka lopulta siirtyy Columbian alemmille korkeuksille. Kolumbian tuella on myös noin 5000 muuta ainutlaatuista kasvilajia.
Pilvimetsät
Kolumbian pilvimetsät istuvat korkeuden alapuolella. Nämä metsät kuuluvat maan Las Orquídeasin kansallispuistoon, joka on nimetty siellä löydettyjen yli 200 orkidealajin mukaan. Pilvimetsät sisältävät myös monia muita Kolumbiasta kotoisin olevia lajeja, mukaan lukien jaguar-, puma-, apina-, peura-, lintu-, lepakko- ja hyönteislajit. Pilvimetsissä asuu myös uhanalainen silmälasikarhu. Tutkijat uskovat, että ilmastonmuutos voi vaikuttaa karhun suosikkikasveihin syömään - pakottaen heidät etsimään ruokaa kovemmin ja kauemmas ja mahdollisesti saattamaan heidät kilpailemaan muiden lajien kanssa.
Amazonin sademetsä
Noin kolmasosa Kolumbiasta kuuluu Amazoniin; kuten muualla maailmassa suurimmalla sademetsällä, tällä alueella on lukuisia ainutlaatuisia lajeja. Vuonna 2013 tutkijat paljastivat kahden uuden lajin löytämisen Kolumbian Amazonista: Cercosaura hypnoides ja Callicebus caquetensis. Cercosaura hypnoides on pieni musta lisko, jonka uskotaan olevan uhanalainen, ja Callicebus caquetensis on yksi Amazonin alueella elävistä noin 20 titi-apina-lajista. Kun nämä apinat ovat vauvoja, he osoittavat tyytyväisyytensä ja kiintymyksensä kuorimalla, kuten pennut.
Rannikkoalueet
Kolumbian rannikkoalueilla on vesi- ja maaekosysteemien rajoilla pääasiassa mangrovemetsät. Hajoavan orgaanisen aineen suuren määrän vuoksi näissä rannikkoekosysteemeissä asuu suuri määrä kaloja. Mangrovemetsissä on lukuisia mangrovelajeja sekä kasvava meren simpukoiden ja nilviäisten populaatio; paikalliset yhteisöt korjaavat usein simpukan, joka tunnetaan nimellä piangua hembra. Useat nisäkkäät asuvat näissä mangrovemetsissä, mukaan lukien tiikerikissat, nutriat ja villisiat, jotka tunnetaan nimellä "tatabro".
Los Llanos (tasangot)
Niityt tai Los Llanos istuvat pääasiassa Orinoco-joen altaan ympärillä, joka sijaitsee Kolumbian ja Venezuelan välillä. Joki itsessään asuu kotoperäinen ja uhanalainen Orinoco-krokotiili, jonka tiedetään saavuttavan 23 jalkaa. Orinoco-kilpikonna, jättiläinen saukko, jättiläinen armadillo ja mustakastanjakotka ovat muita uhanalaisia Los Llanos -lajeja. Tasangoilla on myös lukuisia muuttolintuja, kuten keltajalkaisia ja useita kinkkulajeja.
