Deoksüribonukleiinhappe - DNA - struktuur oli aastaid tagasi näidatud topeltheeliksina, kuid iga haru nimetamise kokkuleppest on saanud segadust nii teadlastele kui ka tudengitele. DNA paaride hulgast nimetatakse ühte DNA kahe avastaja järgi ühte Watsoniks ja teist Crickiks. Kuid teaduskirjanduses ei olda nõus, millisele harule peaks mis nime andma. Watson-Cricki nimesüsteem pidi näitama DNA-struktuuris iga ahela erinevaid funktsionaalseid omadusi, mis on teiste nimetamissüsteemide sama eesmärk. On ülioluline mõista erinevat konteksti, milles üksikud tegevussuunad peavad võtma erinevaid nimesid. Kaks suurepärast näidet on nende erinevad rollid DNA replikatsioonis või transkriptsioonis. Teadmine, mida iga haru bioloogilises protsessis teeb, aitab selgitada, miks talle see nimi pandi.
Sensivastane pole lollus
Transkriptsioon on DNA kopeerimine RNA-sse. Seda teeb ensüüm nimega RNA polümeraas (RNA Pol). RNA Pol loeb ainult ühte kahest DNA ahelast, kui see muudab RNA molekuli. Kaheahelaline DNA molekul jaguneb ja RNA Pol seondub ühe ahelaga, mida see loeb ja kopeerib. Seda ahelat nimetatakse malli ahelaks ehk anti-sense ahelaks. Toodetud RNA molekul on matemaatilise ahelaga komplementaarne, mis tähendab molekuli nukleotiide malli ahel ja RNA molekul sobivad omavahel vastavalt reeglitele: adeniin uratsiilile ja guaniin tsütosiin.
See on mõistlik
Kui RNA-d DNA-st transkribeeritakse, seondub RNA polümeraas matriitsahelaga ja kopeerib selle. Ülejäänud ahelat nimetatakse kodeerivaks ahelaks (vt viide 5) või sens-ahelaks. Arvestades nukleiinhapete aluspaarimisreegleid (A paarid T-ga ja G paarid C-ga), on DNA kodeerival või senss-ahelal identne järjestus tootmisel RNA-ga. Erandiks on see, et RNA sisaldab T (tümiini) asemel nukleotiidi U (uratsiil), mis mõlemad paaristuvad A-ga (adeniin).
Sujuv sõit
Enne mitoosi ehk raku jagunemist peab rakk kopeerima oma DNA, nii et igal tütarrakul oleks identne arv DNA ahelaid. DNA polümeraas on ensüüm, mis kopeerib pikki DNA osi rohkemaks DNA-ks. Replikatsioonihargis tõmbab DNA molekul lahti, moodustades mulli, millesse polümeraas libiseb. Polümeraas seondub lahti keritud DNA mõlema ahelaga ja hakkab tegema mõlemast ahelast koopiaid. Üks koopiatest on tehtud ühe pideva ahelana, millele viidatakse kui juhtivale ahelale. DNA replikatsioon on veel üks juhtum, kus DNA ahelatel on erinevad nimed.
Liikluse peatamine ja minek
DNA redeli paralleelivastane struktuur tähendab, et üks ahel kulgeb peast sabani, teine aga sabast peani. DNA replikatsiooni ajal peab DNA polümeraas lugema ja kopeerima mõlemat ahelat korraga, kuigi need kulgevad vastassuunas. Kuna DNA polümeraas suudab DNA ahelaid lugeda ja kopeerida ainult ühes suunas - sabast peani - ahelasse et Polymerase kohtumisi, mis on orienteeritud pea-saba suunas, ei saa lugeda ja kopeerida pidevana haru. See pea-saba-ahel kopeeritakse lühikeste fragmentidena, mida nimetatakse Okazaki-fragmentideks ja mis hiljem sulanduvad, moodustades ühe pika ahela. DNA replikatsioonis nimetatakse fragmentidena moodustuvat ahelat mahajäävaks ahelaks.