Protistid ja bakterid kuuluvad erinevatesse eluvaldkondadesse, eukarüootidesse ja prokarüootidesse, mida pikutavad evolutsiooni eoonid. Sellegipoolest, nagu kõigil Maa eluvormidel, on neil ühine esivanem ja seega on mitmeid intrigeerivaid sarnasusi. Hoolimata nii protistide kui ka bakterite uskumatust mitmekesisusest, võite teha mõned üldistused selle kohta, mis neil ühist on.
Geneetiline kood
Protistidel, bakteritel ja kõigil teistel organismidel kodeerivad DNA teatud keemiliste aluspaaride järjestused teatud aminohappeid. Kood on peaaegu universaalne selles mõttes, et sama DNA järjestus kodeerib sama aminohapete järjestust nii protistis kui ka bakteris. Selle universaalsuse erandite hulka kuulub asjaolu, et mõned bakterid kasutavad pürolüsiini kodeerimiseks järjestust UAG, mitte stoppkoodonit, nii et seda kasutatakse teistes organismides. Sellegipoolest on kood enamasti märkimisväärne sarnasus bakterite ja protistide vahel.
Ribosoomid
Nii bakterid kui ka protistid transkribeerivad kõigepealt oma DNA koodi lõigud RNA-ks, seejärel tõlgivad selle RNA valguks, kasutades keerukaid struktuure, mida nimetatakse ribosoomideks. Jällegi on protistidel ja bakteritel neid sarnasusi kõigi teiste teadaolevate eluvormidega. Ribosoomi struktuur erineb mõnevõrra bakterite ja eukarüootide vahel nagu protistid. Ka see erinevus on oluline, sest mõned antibiootikumid tapavad baktereid, kasutades ära bakteriaalsete ja eukarüootsete ribosoomide erinevusi.
Rakumembraanid
Nii bakteritel kui ka protistidel on rakumembraanid, mis on valmistatud kemikaalidest, mida nimetatakse fosfolipiidideks. Bakteri või protisti fosfolipiidil on ühes otsas vees lahustuv rühm ja vees lahustumatu saba teiselt poolt, nii et bakterite ja protistide rakumembraanid on ehitatud kahekihilisest fosfolipiidid. Mõlemad sabad osutavad kahekihilise keskme poole. Bakteritel on lisaks rakumembraanile ka rakusein ning mõnel bakteril on nii sisemine kui ka välimine membraan.
Kõrgelt konserveeritud protsessid
Bakteritel ja protistidel on erinevates biokeemilistes protsessides silmatorkav sarnasus, mis on samuti väga sarnane kõigi teiste eluvormide omadega. Protsessi, mida bakterid ja protistid kasutavad glükoosi lagundamiseks, nimetatakse glükolüüsiks. Kuigi on mõningaid variatsioone, toimub glükolüüs peaaegu kõigis teadaolevates organismides. Samamoodi on DNA replikatsiooni protsess bakterite ja protistide vahel väga sarnane, mõningate väikeste erinevustega.
