Geneetikud püüavad rohkem teada saada domineerivatest ja retsessiivsetest alleelidest, mis toovad kaasa teatud tunnused, eriti need, mis võivad põhjustada haigusi või kroonilisi haigusi, nagu sirprakuline aneemia, mis võib elanikkonda kahjustada. Need seisundid on sageli põhjustatud kahe retsessiivse alleeli sidumisest, mis on teatud populatsioonis haruldased. Kuid domineerivad alleelid võivad olla ka populatsioonile kahjulikud ja seega ka selekteeritud.
Geneetilised põhitõed
Haruldaste eranditega saavad kõik igast geenist kaks vormi, millest igaüks on tuntud alleelina, üks emalt ja teine isalt. Enamikul juhtudel on alleel kas domineeriv või retsessiivne ja paaristamine vastutab selle eest, milline omadus avaldub. Alleele tähistab tavaliselt üks täht, mis domineerib domineerivalt suurtähega ja retsessiivse korral väiketähega. Kui kaks domineerivat alleeli on paaritatud või domineeriv ja retsessiivne alleel on paaris, dikteerib domineeriv alleel selle tunnuse. Seega, kui taimel on domineerivad lillad õied (P) ja valged on retsessiivsed (p), siis kui taimel on genotüüp PP, Pp või pP, on tal lillad õied. Ainult pp alleelidega taimedel on valged õied.
Tunnuste valimine
Valitseva alleeli valimine on tegelikult palju lihtsam kui retsessiivne, sest kui indiviidil on domineeriv alleel, siis see omadus avaldub. Eelmises näites lilledega, kui keegi sooviks kõigist tema õue lillakasõielistest taimedest lahti saada, aretaks ta ainult valgeid. See eemaldaks populatsioonist tõhusalt kõik domineerivad alleelid, kuna ühelgi valgeõielistel taimedel pole domineerivaid alleele. Kuna aga lillade õitega taimedel võib olla ka üks alleel valgete õite jaoks, a aednik võiks vabaneda kõigist taimedest, millel on valged õied ja kellel on veel valgeid toitaimi lilled.
Funktsiooni saavutamise domineeriv alleel
Kaht tüüpi domineerivad alleelid võivad kahjustada ja nende vastu saab valida. Esimene on funktsiooni suurendamise alleel, mis põhjustab inimesel omaduse, mida ta tavaliselt ei avaldaks. Meie lillenäites tähendaks see, et õied on üldiselt valged, kuid see geen põhjustab imeliku värvi (lilla) teket. Inimestel on selle nähtuse näiteks kääbuslus, mille käigus FGFR3 geen põhjustab luude kasvu peatumise enne nende üldist kasvu.
Domineerivad negatiivsed alleelid
Teist tüüpi domineerivat alleeli, mis võib olla kahjulik, nimetatakse domineerivaks negatiivseks alleeliks, kuna see toodab valke, mis takistavad teistel valkudel oma tööd teha. Seega on sellel negatiivne mõju. Kui meie lillad õied oleksid toodetud seetõttu, et domineeriv geen blokeeris valge eksponeerimise, oleks see domineeriv geen domineeriv negatiivne alleel. Selle efekti näiteks on p53 valk inimestel, mis takistab teistel valkudel rakkude kasvu reguleerimist. See võimaldab neil kasvada kiiremini kui peaks, põhjustades vähki. Kuna seda omadust ei saa väliselt täheldada, on selle vastu valimine aga palju keerulisem, eriti kuna selle alleeli mõju avaldub sageli alles hilisemas elus. Valiku domineeriva omaduse järgi valimine pole sageli nii lihtne kui meie teoreetilises lillenäites.