Autor: David H. Nguyen, dr.
Ensüüme, mis lisavad DNA ahelale nukleotiide, nimetatakse polümeraasideks, mida on palju. Selle teema keerukuse selgitamine, mõistes, millised polümeraasitüübid millistel tingimustel toimivad. Transkriptsiooniprotsessid, RNA valmistamine DNA-st ja replikatsioon, DNA kopeerimine DNA-st on peamised funktsioonid, mis nõuavad polümeraase nukleotiidide sidumiseks pikkadeks ahelateks. Prokarüootidel, nagu bakterid, ja eukarüootidel, näiteks inimrakkudel, on polümeraasid, mis võivad sõltuvalt kontekstist toimida erinevalt või sarnaselt. Nukleotiidide täpse linkimise põhiteema on aga olemas nii prokarüootides kui ka eukarüootides.
Eukarüootne transkriptsioon
RNA polümeraas II (RNA Pol II) on ensüüm, mis lisab nukleotiide uuele transkriptsiooni käigus tekkivale DNA ahelale. See värvatakse geeni transkriptsiooni alguskohta transkriptsioonifaktorite klastri kaudu, mis seob TATA kasti, mis on nukleotiidide järjestus geeni algusjoone lähedal. Neid transkriptsioonifaktoreid nimetatakse valkude TFII perekonnaks (polümeraas II transkriptsioonifaktori jaoks). Need transkriptsioonifaktorid aitavad RNA polümeraas II-l liikuda mööda kerimata DNA-d. Mööda liikudes ühendab see nukleotiidid uude ahelasse, sobitades vabalt hõljuvad nukleotiidid nende vastavate aluspaaridega DNA matriitsahelas.
Ensüüme, mis lisavad DNA ahelale nukleotiide, nimetatakse polümeraasideks, mida on palju. Selle teema keerukuse selgitamine, mõistes, millised polümeraasitüübid millistel tingimustel toimivad. Transkriptsiooniprotsessid, RNA valmistamine DNA-st ja replikatsioon, DNA kopeerimine DNA-st on peamised funktsioonid, mis nõuavad polümeraase nukleotiidide sidumiseks pikkadeks ahelateks. Prokarüootidel, nagu bakterid, ja eukarüootidel, näiteks inimrakkudel, on polümeraasid, mis võivad sõltuvalt kontekstist toimida erinevalt või sarnaselt. Nukleotiidide täpse linkimise põhiteema on aga olemas nii prokarüootides kui ka eukarüootides.
Prokarüootne transkriptsioon
Bakteriaalne RNA polümeraas II on mitme alaühiku valgu kompleks. Selle asemel, et värvata transkriptsiooni alguskohta TFII perekonna valkude poolt - nagu juhtub eukarüootse versiooniga -, on bakteriaalse RNA Pol II allüksus, mida nimetatakse sigmateguriks. Sigmafaktor viib kogu RNA Pol II kompleksi geeni algusjoonele. Sigmafaktor aitab uurida DNA topeltheeliksi, võimaldades bakteriaalsel RNA Pol II kompleksil libiseda mööda ühte DNA ahelat ja hakata lisama uusi nukleotiide.
Ensüüme, mis lisavad DNA ahelale nukleotiide, nimetatakse polümeraasideks, mida on palju. Selle teema keerukuse selgitamine, mõistes, millised polümeraasitüübid millistel tingimustel toimivad. Transkriptsiooniprotsessid, RNA valmistamine DNA-st ja replikatsioon, DNA kopeerimine DNA-st on peamised funktsioonid, mis nõuavad polümeraase nukleotiidide sidumiseks pikkadeks ahelateks. Prokarüootidel, nagu bakterid, ja eukarüootidel, näiteks inimrakkudel, on polümeraasid, mis võivad sõltuvalt kontekstist toimida erinevalt või sarnaselt. Nukleotiidide täpse linkimise põhiteema on aga olemas nii prokarüootides kui ka eukarüootides.
DNA replikatsioon
DNA replikatsioon on eukarüootide ja prokarüootide vahel üldiselt sarnane. Replikatsioon erineb transkriptsioonist selle poolest, et mõlemad DNA ahelad kopeeritakse korraga - mõlemad DNA ahelad toimivad mallidena. DNA replikatsiooni käigus toodetakse ühe uue DNA ahel pideva ahelana (nimetatakse juhtivaks) ahel), samas kui uue DNA teine ahel on valmistatud lühikeste katkendlike tükkidena (nimetatakse mahajäävaks tegevussuund). DNA polümeraas III on ensüüm, mis lisab nukleotiide pideva juhtiva ahela moodustamiseks. Teine polümeraas, DNA polümeraas I, lisab nukleotiide, et saada katkendlikud fragmendid (nn Okazaki fragmendid) mahajäänud ahelale.
Ensüüme, mis lisavad DNA ahelale nukleotiide, nimetatakse polümeraasideks, mida on palju. Selle teema keerukuse selgitamine, mõistes, millised polümeraasitüübid millistel tingimustel toimivad. Transkriptsiooniprotsessid, RNA valmistamine DNA-st ja replikatsioon, DNA kopeerimine DNA-st on peamised funktsioonid, mis nõuavad polümeraase nukleotiidide sidumiseks pikkadeks ahelateks. Prokarüootidel, nagu bakterid, ja eukarüootidel, näiteks inimrakkudel, on polümeraasid, mis võivad sõltuvalt kontekstist toimida erinevalt või sarnaselt. Nukleotiidide täpse linkimise põhiteema on aga olemas nii prokarüootides kui ka eukarüootides.
Rohkem kui üks polümeraas
Bakterites on viis ja inimestel 15 DNA polümeraase. Need kuuluvad üldjuhul kolme eri klassi: A, B ja X. DNA Pol III, mis teeb DNA replikatsiooni ajal juhtiva ahela, on A-klassi tüüp ja teeb enne DNA kukkumist väga pikki ahelaid (30 000 nukleotiidi). DNA Pol I, mis muudab mahajäänud ahelal olevad lühikesed katkendlikud Okazaki fragmendid, kuulub B-klassi - see teeb fragmente, mis on umbes 600 nukleotiidi pikad. Lõpuks sisaldab klass X polümeraase, mis on seotud kahjustatud DNA parandamisega. Nad lisavad ka nukleotiide, kuid lühikeste ahelate kujul.
seotud artiklid
DNA transkriptsiooni etapid
Mis ensüüm vastutab RNA keti pikendamise eest?
Mis on histooni atsetüülimine?
Kuidas DNA tõlge töötab?
Miks on 61 antikodooni?
Mis on mRNA ja tRNA funktsioonid?
Ensüüm, mis katalüüsib DNA molekuli moodustumist
Vaba ribosoomide tähtsus
Kolm viisi, kuidas RNA molekul on struktuurselt...
DNA-ahelate nimed
Mis on geneetiliste sõnumite dekodeerimise esimene samm?
Kuidas kasutatakse piiravaid ensüüme biotehnoloogias?
Missugused geenid on plasmiididel?
Millised mehhanismid tagavad DNA replikatsiooni täpsuse?
Ribosoomide asukoht rakus
Kuidas teha DNA-mudel torupuhastusvahendite abil
Mida kasutatakse DNA lõikamiseks kindlas asukohas...
Mis vahe on nukleotiidil ja nukleosiidil?
Kuidas kujundada PCR-praimerit
Erinevus transkriptsiooni ja DNA replikatsiooni vahel
Viited
- Raku molekulaarbioloogia: RNA polümeraas II nõuab üldisi transkriptsioonifaktoreid
- Raku molekulaarbioloogia: DNA-sse kodeeritud signaalid ütlevad RNA polümeraasile, kust alustada ja peatada
- Molekulaarne rakubioloogia: Eukarüootse replikatsiooni masinad on üldiselt sarnased E. omaga. coli
- Kriitilised ülevaated taimeteaduses: DNA polümeraaside mitmed funktsioonid
Autori kohta
David H. Nguyen on doktorikraadiga ning vähi bioloog ja teaduskirjanik. Tema eriala on kasvajabioloogia. Samuti tunneb ta suurt huvi sotsiaalse ebaõigluse ja vähi tervisega seotud erinevuste sügavate ristumiskohtade vastu, mis eriti puudutavad etnilisi vähemusi ja orjastatud rahvaid. Ta on Kindle'i e-raamatu "Näpunäiteid ellujäänud kõrg- ja kutsekoolist" autor.
Foto autorid
Comstock / Stockbyte / Getty Images