Saate võrrelda aatomi struktuuri päikesesüsteemiga, kus elektronid tiirlevad tuuma ümber umbes samal viisil kui päikese ümber tiirlevad planeedid. Päike on päikesesüsteemi kõige raskem asi ja tuum mahutab suurema osa aatomi massist. Päikesesüsteemis hoiab gravitatsioon planeete orbiidil; elekter ja muud jõud hoiavad aatomit koos.
Tuum
Aatomi tuum on selle keskne keha, milles on osakesed, mida nimetatakse prootoniteks ja neutroniteks. Prootonite arv tuumas on elemendi aatomnumber; näiteks heeliumi aatomil on alati kaks prootonit ja süsinikul alati kuus. Sama elemendi erinevad neutronite arvud muudavad aatomi "nõod" isotoopideks. Näiteks enamikul vesinikuaatomitest pole neutroneid, kuid harvadel vähestel on üks ja vähemal veel kaks. Spetsiaalne jõud, mida teadlased nimetavad "tugevaks jõuks", hoiab prootoneid ja neutrone koos tuuma sees.
Prootonid
Prootonid on aatomi ainsad positiivselt laetud subatomaarsed osakesed. Selle elektrilaeng on 1,6022 * 10 ^ -19 kulon - sama mis elektronil, ehkki elektroni laeng on negatiivne. Prootoni mass, 1,67 * 10 ^ -27 kilogrammi, on neutronile väga lähedal ja umbes 1837 korda raskem kui elektron.
Elektronid
Elektronid, mida tavaliselt tähistatakse sümboliga "e", on ainsad aatomis leiduvad negatiivselt laetud osakesed. Elektroni mass on 1,1 * 10 ^ -31 kg. Elektronid on rühmitatud erinevatesse "kestadesse", mis asuvad väljaspool tuuma; igas kestas on piiratud arv elektrone ja arv sõltub koore tüübist. Elektronkihid on tuumast suhteliselt kaugel, mistõttu aatom on tühjaks jäänud enam kui 99 protsenti.
Neutronid
Neutronid, millel puudub elektrilaeng, asuvad tuuma sees koos prootonitega. Kõigil elementidel on vähemalt üks neutron, välja arvatud vesinik. Neutroni mass on 1,6749 * 10 ^ -27 kg. Mõned radioaktiivsed elemendid, näiteks uraan, väljutavad osa nende neutronitest; kui see juhtub, eksleb neutron keskmiselt umbes 15 minutit aatomist väljas, enne kui see laguneb prootoniks ja elektroniks.