Kui seeme idaneb, taastub embrüo kasv. See nõuab õigeid keskkonnatingimusi. Temperatuur peab olema optimaalne, samas peab olema piisavalt vett ja hapnikku. Seemne puhkeseisund tekib siis, kui elujõuline seeme ei idane vaatamata vajalikele keskkonnatingimustele. Esmane puhkeaeg on mõiste, kui seeme vabaneb taimest juba puhkeseisundis. See erineb sekundaarsest puhkeseisundist, kui seeme pärast keskkonda laskmist keskkonnategurite mõjul uinub.
Esmase puhkeseisundi põhjused
Neid kahte tüüpi esmast puhkeseisundit nimetatakse embrüo puhkeseisundiks ja karvkatte põhjustatud puhkeseisundiks. Embrüo puhkeseisund on tingitud embrüole omasest omadusest, enamasti kasvu inhibiitoritest või kasvuensüümide puudumisest. Karvkatte põhjustatud puhkeseisundi põhjustab seemnekest. Teised ümbritsevad koed, näiteks endosperm, perikarp või ekstraflooraalsed elundid, võivad põhjustada karvkatte põhjustatud puhkeseisundit. On viis põhilist mehhanismi, mis põhjustavad karvkatte põhjustatud puhkeseisundit. Need mehhanismid on mehaaniline piirang, hapniku mitteläbilaskvus, kasvu inhibiitorid ja blokeeritud vee omastamine.
Mehaaniline piirang
Idanemise ajal tungib radikaal (embrüo osa, mis muutub primaarseks juureks) tavaliselt seemnekestasse. Mõnel puhkeseisundil on seemnekest siiski liiga jäik, et puruneda. Mehaanilise piiramise levinud põhjus on lignifikatsioon. ÜRO Toidu- ja Põllumajandusorganisatsiooni andmetel tähendab see, et rakusein on ligniiniga immutatud. Ligniin on amorfne materjal, mis koosneb fenüülpropanoidühenditest. Mittekohustuslikud koed võivad pärssida ka embrüo laienemist. Näiteks salati seemnete endosperm võib idanemist takistada. Idanemise võimaldamiseks võib endospermi nõrgendamiseks vaja minna rakuseina lagundavaid ensüüme.
Hapniku mitteläbilaskvus
Eksperdid usuvad, et seemnekatted võivad idanemist pärssida, piirates embrüo hapnikku, vahendab Plant Physiology Online. Uuringud on näidanud, et hapniku infusioon võib põhjustada varem uinunud seemne idanemist. Seda on tehtud seemnekesta töötlemisel kontsentreeritud hapnikuga või väikese auku tegemisega mantel tihvtiga, andes seega tõendeid hapniku läbilaskvuse ja puhkeseisundis. Kuid ajakirjas Journal of Experiment Botany ilmunud artikkel viitab sellele, et hapniku läbilaskvus ei pruugi olla mõne seemne tegur. Hapniku rolli vahel puhkeseisundis on endiselt palju teadmata.
Kasvu inhibiitorid
Uinumise põhjuseks võivad olla ka kasvu inhibiitorid. Need ensüümid takistavad seemne idanemist. Seemnekatted ja perikarpid võivad sisaldada kõrgeid kasvu inhibiitoreid, mis pärsivad idanemist. Samuti võib seemnekest takistada seemne puhkeseisundit põhjustavate kasvu inhibiitorite pääsemist.
Vee mitteläbilaskvus
Võimetus vett imada on veel üks võimalik seemnete puhkeseisundi põhjus. Vahalised küünenahad, suberiseeritud kihid ja lignifitseeritud sklereidid võivad kõik kaasa aidata vee läbilaskmatusele. Seda tüüpi puhkeseisund on taimede seas levinud kuivas ja semiaridses keskkonnas.
Embrüo puhkeaeg
Embrüo puhkeaeg erineb karvkatte põhjustatud puhkeseisundist, kuna see pole tingitud seemnekestaga seotud teguritest. Ameerika taimebioloogide seltsi uuring näitas, et kasvu inhibiitorid, täpsemalt endogeenne abstsisihape (ABA), võivad põhjustada embrüo puhkeseisundit. Kasvustimulaatorite, näiteks giberelliinhappe (GA) puudumine võib samuti põhjustada embrüo puhkeseisundit, vahendab Plant Physiology Online.