Vihmametsade ökosüsteemid pakuvad kodu kõige tihedamatele ja mitmekesisematele loomakooslustele Maa peal. Vihmametsi kasutatakse aga rikkalike ressursside pärast pidevalt ära. Inimeste tavad, nagu kaevandamine ja metsade hävitamine, avaldavad neile elupaikadele tõsist mõju, põhjustades lugematul hulgal loomaliikidel murettekitava kiirusega oma kodu.
Linnud
Mitmeid Lõuna-Ameerika ja Kesk-Ameerika vihmametsade toukaanide, papagoi ja teiste troopiliste lindude liike ähvardab metsaraie ja muud metsade hävitamise põhjused hävitada. Harpy-kotkas, üks tuntumaid kotkaliike kogu maailmas, areneb troopilistes vihmametsa madalikel Mehhiko lõunaosast kuni Boliivia idaosani; selle linnu elupaik kahaneb pidevalt tänu lageraielangetustele ja pesitsuskohtade hävitamisele tööstuslikest tavadest nagu kaevandamine ja naftapuurimine. Elupaikade kadu ohustab ka tuhandeid rändlinnuliike. Need liigid rändavad Põhja-Ameerika suve ajal põhja poole ja talvel tagasi troopikasse; üha rohkem naaseb igal aastal, et leida kodu ja / või hävitatud pesitsuskohti.
Imetajad
Vihmametsas kaotavad oma kodu väga paljud imetajaliigid, alates kõige väiksematest närilistest kuni suurimate kiskjateni. Paljud suuremad imetajad vajavad palju toitu ja / või jahti pidama. Tööstuspraktika edenedes teatud piirkondades peavad vihmametsade imetajad, näiteks gorillad, jaaguarid ja pumas, piirduma killustatud elupaikadega, kellel pole piisavalt ressursse. Metsade hävitamine mõjutab kõige otsesemalt arboreaalseid imetajaid (neid, kes elavad puudes), nagu lendorav ja viljahiir, samuti mitut ahviliiki. Terved kogukonnad jäävad kodutuks, sundides neid kohanema puuta keskkonnaga, milleks nad pole valmis.
Roomajad ja kahepaiksed
Metsade hävitamine on enamiku vihmametsa roomajate elupaikade kadumise peamine põhjus, samas kui paljud kahepaikseliigid kaotavad oma kodu ka naftapuurimis- ja kaevandamistavad, mis saastavad tiike, jõgesid ja ojad, sundides neid leidma poolveelistele eluviisidele uusi veeallikaid. Ohustatud ja ohustatud roomajate ja kahepaiksete liikide hulka kuuluvad kuldkärnkonn, Madagaskari päevakekk ja iguaanid, samuti mitmed mürk-konnaliigid, eriti Colombia.