Osaliselt Andide põhjaosas paiknev rannajoon nii Vaikse ookeani kui Kariibi mere ääres. Colombia ainulaadne geograafia moodustab selle piires viis väga eristatavat ökosüsteemi: Alpide tundra või paramo; vihmamets; kõrgel pilvemetsad; rannikualad; ja tasandikud - ehk los llanos. Kuna Colombia on ekvaatorile nii lähedal, ei läbi see olulisi hooajalisi erinevusi.
Paramos
Paramos on kõrgmäestiku troopilised ökosüsteemid, mida teadusringkonnad alles hakkavad mõistma. Uuringud on näidanud, et need ainulaadsed ökosüsteemid genereerivad uusi liike kiiremini kui ükski teine Maa ökosüsteem. Kolumbia toetus on koduks 68 liikile nõrkadele õistaimedele, mis püüavad mööduvatest ududest vett. Koos ökosüsteemi samblike ja sammaldega filtreerivad ja reguleerivad frailejonid vett, mis lõpuks jõuab Columbia madalamatele kõrgustele. Colombia paramos on koduks veel umbes 5000-le ainulaadsele taimeliigile.
Pilvemetsad
Kolumbia pilvemetsad asuvad kõrgusel toetuse all. Need metsad kuuluvad riigi Las Orquídeas rahvusparki, mis on nimetatud enam kui 200 seal leitud orhideeliigi järgi. Pilvemetsad sisaldavad ka paljusid teisi Kolumbiast pärinevaid liike, sealhulgas jaaguari, puma, ahvi, hirve, lindude, nahkhiirte ja putukate liike. Pilvemetsades elavad ka ohustatud prill-karud. Teadlased usuvad, et kliimamuutused võivad mõjutada karu lemmiktaimi söömiseks - sundides neid toitu raskemini ja kaugemalt otsima ning võib-olla konkureerima teiste liikidega.
Amazonase vihmamets
Ligikaudu kolmandiku Colombiast katab Amazon; Sarnaselt ülejäänud maailma suurima vihmametsaga elab selles piirkonnas arvukalt unikaalseid liike. 2013. aastal paljastasid teadlased Kolumbia Amazonases kahe uue liigi avastamise: Cercosaura hypnoides ja Callicebus caquetensis. Cercosaura hypnoides on väike must sisalik, keda arvatakse ohustatuna ja Callicebus caquetensis on üks umbes 20 Amazonases elavast titi-ahvi liigist. Kui need ahvid on imikud, näitavad nad oma rahulolu ja kiindumust nurrudes nagu kassipojad.
Rannikupiirkonnad
Kolumbia rannikupiirkonnas asuvad vee- ja maismaaökosüsteemide piiridel peamiselt mangroovimetsad. Laguneva orgaanilise aine suure hulga tõttu on nendes rannikuökosüsteemides suur hulk kalu. Mangroovimetsad sisaldavad arvukalt mangrooviliike, samuti kasvavat mere kahepoolmeliste ja molluskite populatsiooni; kohalikud kogukonnad koristavad sageli kahepoolmelist, mida tuntakse kui piangua hembra. Nendes mangroovimetsades elavad mitmed imetajad, sealhulgas tiigerkassid, nutria ja metssead, mida tuntakse kui "tatabro".
Los Llanos (tasandikud)
Rohumaad ehk Los Llanos asuvad peamiselt Colombia ja Venezuela vahel asuva Orinoco jõgikonna ümber. Jõgi ise on koduks põlisele ja ohustatud Orinoco krokodillile, mille pikkus on teadaolevalt 23 jalga. Orinoco kilpkonn, hiidmasaar, hiiglaslik armadillo ja must-kastanikotkas on ka teised Los Llanose ohustatud liigid. Tasandikel on ka arvukalt rändlinde, näiteks kollakaid ja mitut liiki liblikaid.