Kvarts ja kaltsiit on kaks tavalist looduslikult esinevat mineraali. Tegelikult on kvarts maapõuest kõige arvukamalt mineraal, samas kui kaltsiit on tavaline komponent settekivimites (eriti lubjakivis), moondemarmoris ja isegi erinevate merekarpides organismid. Kuigi kristalne kvarts ja kaltsiit võivad välimuselt olla sarnased, on nende kahe vahel palju kvalitatiivseid erinevusi.
Keemiline koostis
Kaltsiit on kaltsiumkarbonaadi polümorf, mis tähendab, et see on üks paljudest kaltsiumkarbonaadi kristallvormidest (teine oleks argoniit), kvarts on aga ränidioksiid. Mõlemad mineraalkristallstruktuurid kuuluvad trigonaalse kristalli kuju kategooriasse, ehkki kaltsiit erineb veidi selle poolest, et sellel on romboheedriline võre struktuur. Kristallide struktuuri ja keemilise sideme erinevus tähendab, et kvarts on oluliselt raskem kui kaltsiit. Hea test kahe mineraali eristamiseks on üksteise kriimustamine; see, millel on kriimustusi, on kaltsiit. Pealegi, kaltsiit, nagu ka teised karbonaadid, lahustub happes.
Läige
Läige, mida nimetatakse ka läikeks, on termin, mida kasutatakse valguse peegeldumise või neeldumise viisiks mineraali, kivimi või kristalli pinnal. Kvartsil on tavaliselt klaaskeha läige (see tähendab, et see tundub klaasjas), samas kui kaltsiidiga on suurem variatsioon. Kaltsiidil on läige, mis ulatub klaaskehast vaiguse (sileda ja vaigutaolise) kuni tuhmina (kulgeva ja peegeldamatu).
Värv
Kaltsiit on enamasti värvitu (näib valge või selge), kuigi sageli on oranži, kollase, sinise, punase, roosa, pruuni, rohelise, halli ja musta tooni. Kvarts on üldjuhul ka valge või selge, kuid on sageli hägune või segatud lillade, roosade, pruunide, mustade ja hallidega.
Lõhustamine
Teine viis erinevate mineraalide eristamiseks ja klassifitseerimiseks on nende lõhustamine. Kui mineraal purustatakse nüri jõuga (nt haamriga), puruneb see kristallstruktuurile omasel nõrkusetasandil. Neid lennukeid nimetatakse lõhustamiseks. Kaltsiit puruneb ideaalselt kolmes suunas vastavalt oma rhombohedroni võre struktuurile. Kvarts seevastu ei purune puhtalt ja sellel on ebaselge lõhenemine.