Väga vähesed bakterid toodavad endospoore. Ainult mõned neist Firmicute'i perekonna liikidest toodavad endospoore, mis on mittepaljunevad struktuurid, mis sisaldavad DNA-d ja osa tsütoplasmast. Endospoorid ei ole tõelised eosed, kuna nad ei ole bakteri järeltulijad. Endospoorid tekivad siis, kui bakterid satuvad äärmuslikesse või ebasoodsatesse keskkonnatingimustesse. Nad suudavad pikka aega ellu jääda ka toidunäljas ning kemikaalide ja temperatuuride mõjul, mis tavaliselt bakterid tapaksid.
Bacillus bakterid
Bacillus perekonna baktereid uuritakse kõige sagedamini kõigist endospore tootvatest bakteritest. Bacillus-bakterid on mitmekesised ja arenevad paljudes erinevates keskkondades. Selle bakteri endospoorid on paljudele organismidele, sealhulgas inimestele, väga mürgised. Haigustekitaja Bacillus anthracis on tuntud toksiin, mida on kasutanud nii teadlased kui ka terroristid. Bacilluse liike on aga veel palju.
Clostridium bakterid
Sarnaselt teiste endospore tootvate bakteriliikidega on ka Clostridium bakterid grampositiivsed, mis näitab, et neil on sarnased omadused nagu rakuseina struktuur. Grampositiivsed bakterid on tundlikud samade või lähedaste antibiootikumide suhtes. Clostridium perekonna bakterid põhjustavad paljusid inimhaigusi, alates kergest toidumürgitusest kuni botulismi, teetanuse ja gaasigreeni.
Desulfotomaculum bakterid
Sarnaselt teiste endospoori tootvate bakteritega on ka Desulfotomaculum perekonna bakterid vastutavad toidu riknemise ja haiguste eest. Desulfotomaculum bakterid võivad halvasti konserveeritud toiduainete rikneda. Seal, kus neid on palju, tekitavad nad ebameeldiva väävlilaadse lõhna.