Η δομή του δίκλωνου DNA είναι καθολική σε όλα τα ζωντανά κύτταρα, αλλά υπάρχουν διαφορές στις μεθόδους εξαγωγής γονιδιωματικού DNA από ζωικά και φυτικά κύτταρα. Αν και το γονιδιωματικό DNA ζει στον πυρήνα των κυττάρων, η ποσότητα και η καθαρότητα του εκχυλισμένου DNA εξαρτάται από τον τύπο και το μέγεθος του κυττάρου. Για παράδειγμα, ορισμένα κύτταρα περιέχουν περισσότερο DNA και ακαθαρσίες από άλλα. Διαβάστε παρακάτω για να μάθετε περισσότερα σχετικά με τις διαφορές εξαγωγής DNA.
Γενική εκχύλιση DNA
Εάν αντιμετωπίσετε φυτικά και ζωικά κύτταρα με σαπωνώδη ουσία, θα υποβαθμίσει τα λιπίδια στα κύτταρα και τις πυρηνικές μεμβράνες. Στη συνέχεια, το μείγμα DNA θα διαχωριστεί από τις κυτταρικές μεμβράνες και τις πρωτεΐνες. Στη συνέχεια, μπορείτε να χρησιμοποιήσετε αλκοόλ για να καθιζάνετε το DNA στο διάλυμα. Ανάλογα με την ποσότητα του δείγματος, το DNA μπορεί να είναι ορατό με γυμνό μάτι. Ωστόσο, λάβετε υπόψη ότι αυτή η απλή διαδικασία δεν παράγει απαραίτητα DNA υψηλής καθαρότητας.
Κύτταρα φυτών και ζώων
Τα φυτικά κύτταρα διαφέρουν από τα ζωικά κύτταρα λόγω του άκαμπτου κυτταρικού τους τοιχώματος και των οργανιδίων όπως ο χλωροπλάστης. Περιέχουν επίσης πρωτεΐνες και ένζυμα που παίζουν ρόλο στη φωτοσύνθεση. Ορισμένα φυτικά κύτταρα έχουν πολυπλοειδία, που σημαίνει ότι έχουν περισσότερα από ένα αντίγραφα κάθε χρωμοσώματος ανά κύτταρο. Επιπλέον, οι κυτταρικές διεργασίες που συμβαίνουν σε φυτά όπως η φωτοσύνθεση παράγουν μια σειρά δευτερογενών μεταβολιτών. Τα ζωικά κύτταρα δεν έχουν κυτταρικό τοίχωμα, αλλά χρειάζονται ακόμη χημικά όπως το δωδεκυλοθειικό νάτριο (SDS) για να διαταράξουν την κυτταρική μεμβράνη για να απελευθερώσουν γονιδιωματικό DNA.
Εκχύλιση DNA φυτού
Το γονιδιωματικό DNA του φυτού είναι πιο δύσκολο να εξαχθεί λόγω του κυτταρικού τοιχώματος του φυτού. Μπορείτε να την αφαιρέσετε με ομογενοποίηση ή προσθέτοντας κυτταρινάση για να υποβαθμίσετε την κυτταρίνη που αποτελεί το κυτταρικό τοίχωμα. Επιπλέον, οι μεταβολίτες που υπάρχουν στο φυτικό κύτταρο μπορεί να παρεμποδίσουν την εκχύλιση γονιδιωματικού DNA μολύνοντας το δείγμα DNA κατά τη διάρκεια της διαδικασίας καθίζησης.
Εκχύλιση DNA ζώων
Τα λευκοκύτταρα περιφερικού αίματος είναι η κύρια πηγή γονιδιωματικού DNA των ζώων, αλλά η συλλογή δειγμάτων είναι δύσκολη επειδή το αίμα πρέπει να προέρχεται απευθείας από το ζώο. Το αίμα περιέχει μια σειρά ενώσεων όπως πρωτεΐνες, λιπίδια, λευκά αιμοσφαίρια, ερυθρά αιμοσφαίρια, αιμοπετάλια και πλάσμα, τα οποία μπορούν να μολύνουν το δείγμα DNA. Ωστόσο, ο πρωταρχικός μολυντής του ζωικού DNA που εξάγεται από δείγματα αίματος είναι η αίμη, η οποία είναι το μη πρωτεϊνικό συστατικό της αιμοσφαιρίνης.
Οι διαφορές DNA
Οι διαφορές μεταξύ του DNA των φυτών και των ζώων βρίσκονται στην ακολουθία των βάσεων στην έλικα. Οι ενώσεις που βρίσκονται στα φυτικά κύτταρα απουσιάζουν σε ζωικά κύτταρα, και οι αλληλουχίες βάσης DNA αντανακλούν αυτό. Επίσης, το γονιδιωματικό φυτικό DNA είναι συχνά μεγαλύτερο από το ζωικό DNA. Αυτές οι διαφορές επηρεάζουν επίσης τις μεθόδους εκχύλισης, την απόδοση και την καθαρότητα του DNA.