Πώς να αναγνωρίσετε ένα άγνωστο βακτήριο στη μικροβιολογία

Ξεκινήστε τη διαδικασία αναγνώρισης άγνωστων βακτηριδίων παρατηρώντας τα φυσικά χαρακτηριστικά τους, όπως το κυτταρικό τοίχωμα, το σχήμα και τους δεσμούς. Χρησιμοποιήστε τυπικές εργαστηριακές διαδικασίες, όπως χρώση κυττάρων, καλλιέργεια και αλληλουχία DNA για να περιορίσετε περαιτέρω την ταυτότητά σας. Τα βακτήρια γενικά ομαδοποιούνται σε είδη σύμφωνα με τα φυσικά και μεταβολικά χαρακτηριστικά τους, παρά τις γενετικές τους σχέσεις μεταξύ τους.

Τα ευβακτήρια είναι τα λεγόμενα αληθινά βακτήρια. Διακρίνονται από τα αρχαία βακτήρια, τα οποία σχηματίζουν ένα ξεχωριστό βασίλειο. Τα ευβακτήρια είναι προκαρυωτικά, που σημαίνει ότι στερούνται πυρηνικής μεμβράνης. Τα περισσότερα έχουν κυτταρικές μεμβράνες και κυτταρικά τοιχώματα. Τα βακτήρια με τοιχώματα με πυκνά κύτταρα ονομάζονται θετικά κατά gram επειδή είναι ευαίσθητα στο θάνατο κατά τη διάρκεια μιας δοκιμής που ονομάζεται Gram stain. Το Gram stain είναι το πρώτο τεστ που χρησιμοποιείται στην βακτηριακή ταξινόμηση. Τα βακτήρια με λεπτά ή απουσία τοιχώματα κυττάρων είναι αρνητικά κατά gram επειδή δεν παγιδεύουν τη βαφή χρώματος Gram.

Τα σφαιρικά βακτήρια ονομάζονται κόκκοι, τα βακτήρια που σχηματίζουν ευθείες ράβδους ονομάζονται βακίλια και τα βακτήρια με ενδιάμεσο σχήμα ονομάζονται κοκοβακίλλοι. Όλα αυτά μπορεί να είναι αρνητικά κατά gram ή θετικά κατά gram. Τα άκαμπτα, σπειροειδή βακτήρια είναι γνωστά ως σπιρίλλα και είναι μόνο αρνητικά κατά gram. Τα εύκαμπτα, ανεξάρτητα κινητά, σπειροειδή βακτήρια ονομάζονται σπιροχέτες και είναι ουδέτερα κατά gram. Τέλος, οι άκαμπτες ράβδοι σε σχήμα κόμμα ονομάζονται vibrios και είναι αρνητικές κατά gram. Μερικά ελάχιστα γνωστά και κακώς κατανοητά βακτήρια έχουν διαφορετικά σχήματα, όπως το αστέρι σε σχήμα αστεριού και τα εργαστήρια σε σχήμα τσεκουριού. Υπάρχουν επίσης δύο ενδιάμεσες βακτηριακές ομάδες. Το Rickettsia είναι παρόμοιο με τους ιούς, έχει ποικιλία σχημάτων, είναι αρνητικά κατά gram και μπορεί να επιβιώσει μόνο σε άλλα κύτταρα. Το μυκόπλασμα, που είναι παρόμοιο με τους μύκητες, στερείται κυτταρικών τοιχωμάτων και περιλαμβάνει πολλά ειδικά για είδη, πνευμονικά παθογόνα που προκαλούν πνευμονία.

Οι κόκκοι και οι βάκιλοι ταξινομούνται περαιτέρω από τους δεσμούς που σχηματίζουν μετά την κυτταρική διαίρεση. Το Diplococci και το diplobacilli κολλάνε σε ζευγάρια. Οι στρεπτόκοκκοι και οι στρεπτοβακίλλοι σχηματίζουν αλυσίδες. Το Tetrad cocci παραμένει σε τετράγωνα τεσσάρων βακτηρίων. Οι Sarcinae cocci σχηματίζουν κύβους οκτώ βακτηρίων και οι σταφυλόκοκκοι σχηματίζουν συστάδες.

Εάν έχετε ένα άγνωστο βακτήριο και θέλετε να το αναγνωρίσετε, συνήθως θα εκτελέσετε μια κηλίδα γραμμαρίου και στη συνέχεια θα παρατηρήσετε την εμφάνιση της αποικίας και τα μεμονωμένα χαρακτηριστικά. Σε αυτό το σημείο, μπορείτε να πείτε ότι έχετε, για παράδειγμα, ένα αρνητικό κατά gram, αερόβιο στρεπτοβακίλλι. Στη συνέχεια, μπορείτε να συγκρίνετε το δείγμα σας με διάφορα γνωστά βακτήρια τοποθετώντας το σε διαφορετικά μέσα καλλιέργειας ενθαρρύνει την ανάπτυξη ορισμένων ειδών και αναστέλλει άλλα, ή δοκιμάζοντας το δείγμα για διαφορετικά γνωστά βακτηρίδια υποπροϊόντα. Ως τελική λύση, η αλληλούχιση DNA μπορεί να καθορίσει εάν έχετε ένα γνωστό ή άγνωστο βακτηριακό είδος ή στέλεχος, υπό την προϋπόθεση ότι το συγκρίνετε με ένα είδος ή στέλεχος του οποίου το γονιδίωμα έχει ήδη ακολουθηθεί.