Νεφρίδια, κουλουριασμένα σωληνοειδή όργανα που μοιάζουν με αγωγούς, φιλτράρουν και απομακρύνουν τα απόβλητα από το σώμα ενός γαιοσκώληκα. Σε λιγότερο ανεπτυγμένα σκουλήκια, όπως το επίπεδο σκουλήκι ή το rotifer, η νεφρίδια δεν είναι τόσο εξειδικευμένη και βρίσκονται σε διάφορα κύτταρα σε όλο το σώμα του πλάσματος. Σε πιο προηγμένα τμηματοποιημένα σκουλήκια, όπως το γαιοσκώληκα, η νεφρίδια ομαδοποιείται συνήθως σε ζεύγη σε όλα τα τμήματα του σώματος του σκουληκιού. Αυτά τα ζεύγη νεφριδίων ονομάζονται για τη θέση τους στην ανατομία των σκουληκιών. Κάθε ομάδα έχει ομοιότητες, είναι όλοι αγωγοί αποβλήτων, αλλά ο καθένας έχει επίσης ξεχωριστές λειτουργίες.
Η φαρυγγική νεφρίδια αποτελείται από μεγάλους αριθμούς μικρότερων νεφριδίων ομαδοποιημένων σε τρία σύνολα ζευγαρωμένων χαυλιόδοντων. Αυτά τα ομαδοποιημένα νεφρίδια φιλτράρουν άζωτο από τις συστάδες των τριχοειδών αγγείων. Τα άκρα όλων των φάρυγγων νεφριδίων συναντιούνται και σχηματίζουν έναν μεγάλο αγωγό αποβλήτων που απορρίπτει στον θάλαμο φάρυγγα και στοματικό σωλήνα, έναν σωλήνα που εκτείνεται από το στόμα προς τον φάρυγγα.
Η σηπτική νεφρίδια βρίσκεται και στις δύο πλευρές του διαφράγματος - δομές τύπου νήματος που συγκρατούν το δέρμα σε όργανα κάτω από αυτό - σε σειρές σαράντα ή πενήντα μεμονωμένων νεφριδίων. Εμφανίζονται μετά το 15ο τμήμα, και αδειάζουν σε ένα ζευγάρι εκκριτικών αγωγών που οδηγούν στην κύρια κοιλότητα του εντέρου. Αυτό το σύστημα νεφρίδας είναι υπεύθυνο για τη διατήρηση της ισορροπίας του νερού ή της οσμορυθμίσεως στον γαιοσκώληκα.
Εκατοντάδες (200 έως 250 ανά τμήμα) των στοιχειωδών νεφριδίων βρίσκονται σε όλο το τοίχωμα του σώματος του γαιοσκώληκα (σε όλα εκτός από τα δύο πρώτα τμήματα). Αυτά τα μικροσκοπικά νεφρίδια χρησιμεύουν για τη διοχέτευση αζωτούχων αποβλήτων από το εσωτερικό του σκουλήκι στο εξωτερικό έδαφος.