Η φυγόκεντρος είναι μια συσκευή που αποτελείται από ένα διαμέρισμα που περιστρέφεται πάνω σε έναν κεντρικό άξονα. Η κίνηση περιστροφής προκαλεί το διαχωρισμό των υλικών με βάση τις διαφορετικές βαρύτητές τους. Ένας ρότορας φυγοκέντρησης είναι η περιστρεφόμενη μονάδα της φυγόκεντρου, η οποία έχει σταθερές τρύπες διάτρητες σε γωνία. Οι δοκιμαστικοί σωλήνες τοποθετούνται μέσα σε αυτές τις οπές και ο ρότορας περιστρέφεται για να βοηθήσει στον διαχωρισμό των υλικών. Υπάρχουν τρεις τύποι ρότορα φυγοκέντρησης: στροφείο ταλάντευσης, σταθερή γωνία και κάθετοι ρότορες.
Ένας ρότορας ταλάντευσης συνήθως υποστηρίζει δείγματα που κυμαίνονται σε όγκο από 36 mL έως 2,2 mL. Οι κούνιες-κουβάδες μπορούν να υποστηρίξουν δύο τύπους διαχωρισμού: ρυθμός ζωνών και ισοπυκνικοί. Οι κάδοι ταλάντευσης προτιμώνται για διαχωρισμούς ρυθμού-ζωνών, επειδή η απόσταση μεταξύ του εξωτερικού του μηνίσκου και του εξωτερικού του πυθμένα του σωλήνα είναι αρκετά μεγάλη για να πραγματοποιηθεί διαχωρισμός.
Οι ρότορες σταθερής γωνίας χρησιμοποιούνται συνήθως για εφαρμογές σφαιροποίησης είτε για σωματίδια σφαιριδίων από ένα εναιώρημα και για την απομάκρυνση της περίσσειας συντρίμμια, είτε για τη συλλογή του σφαιριδίου. Οι κοιλότητες ρότορα κυμαίνονται από 0,2 mL έως 1 mL. Η πιο σημαντική πτυχή στην απόφαση χρήσης ενός ρότορα σταθερής γωνίας είναι ο παράγοντας Κ. Ο συντελεστής Κ δείχνει πόσο αποτελεσματικό μπορεί ο στροφέας να σφαιροποιηθεί με τη μέγιστη ταχύτητα. Όσο χαμηλότερος είναι ο συντελεστής Κ, τόσο υψηλότερη είναι η αποτελεσματικότητα σβόλων.
Οι κάθετοι ρότορες είναι εξαιρετικά εξειδικευμένοι. Συνήθως χρησιμοποιούνται για τη δέσμευση του DNA σε χλωριούχο καίσιο. Οι κάθετοι ρότορες έχουν πολύ χαμηλούς συντελεστές Κ, κάτι που είναι χρήσιμο εάν το σωματίδιο πρέπει να κινείται μόνο σε μικρή απόσταση έως ότου σφαιροποιηθεί. Ο χρόνος λειτουργίας σε κάθετους ρότορες είναι μικρός.