Ein Allel ist eine mögliche kodierende Sequenz eines Gens. Ein häufiges Missverständnis oder eine fehlerhafte Terminologie ist, dass es Gene für bestimmte Merkmale gibt. Gene steuern zwar verschiedene Merkmale eines Organismus, wie Haarfarbe oder Augenfarbe, aber die tatsächliche Ausprägung eines Merkmals hängt davon ab, welches Allel dominant ist. Zum Beispiel kann das Gen für die Augenfarbe beim Menschen ein Allel für braune Augen und ein Allel für blaue Augen oder ein Allel für braune Augen und eines für grüne Augen haben. Menschen sowie andere Lebensformen, die zwei Kopien jedes Chromosoms haben, haben auch zwei Kopien jedes Gens, um Allele zu speichern.
Die beiden Kopien eines Gens, eine auf jedem der Chromosomen, enthalten jeweils ein Allel. Homozygotie tritt auf, wenn die beiden Genkopien das gleiche Allel für einen bestimmten Phänotyp oder ein exprimiertes Merkmal enthalten. Heterozygotie tritt auf, wenn die beiden Allele unterschiedlich sind. Phänotypen können entweder dominant oder rezessiv sein. Wenn ein Phänotyp dominant ist, muss nur eines der Allele dafür vorhanden sein. Wenn es rezessiv ist, müssen beide Allele vorhanden sein.
Laut dem Utah State Office of Education kann ein Punnett-Quadrat verwendet werden, um die Wahrscheinlichkeit vorherzusagen dass ein bestimmter Genotyp bei den Nachkommen auftritt, indem die Allele der beiden Eltern genommen und kombiniert werden Sie. Der Genotyp beeinflusst den Phänotyp, je nachdem, ob die Allele dominant oder rezessiv sind. Das grundlegende Punnett-Quadrat ist in vier kleinere Quadrate unterteilt. Die möglichen Gene eines Elternteils sind über den oberen beiden Quadraten aufgelistet, das andere daneben geht senkrecht nach unten auf der linken Seite. Großbuchstaben bezeichnen dominante Allele und Kleinbuchstaben bezeichnen rezessive Allele. Zum Beispiel würde ein homozygotes dominantes Gen für braune Augen als BB geschrieben und ein heterozygotes als Bb. Ein homozygot-rezessives Gen würde als bb geschrieben werden. Nimmt man die Buchstaben neben jedem Quadrat, würde für eine Bb x Bb-Kreuzung die Wahrscheinlichkeit eines BB-Genotyps 25 Prozent, Bb 50 Prozent und bb 25 Prozent betragen. In Bezug auf den Phänotyp hat der Nachwuchs laut sciencekidsathome.com eine 75-prozentige Chance, braune Augen zu haben, da braune Augen ein dominanter Phänotyp sind.