So berechnen Sie den isoelektrischen Punkt von Peptiden

Peptide sind kurze Polymerfragmente, die aus Aminosäuren bestehen. Jedes Peptid hat eine bestimmte Aminosäuresequenz, die mit einem Drei-Buchstaben- oder Ein-Buchstaben-Code bezeichnet ist; zum Beispiel wird die Aminosäure Alanin als „Ala“ oder „A“ abgekürzt. Die Ladung der Peptide in der Lösung hängt von der Acidität der Lösung ab. Der isoelektrische Punkt (pI) bezieht sich auf den Aciditätswert der Lösung, bei dem das Peptidmolekül die Nettoladung Null hat. Die Löslichkeit des Peptids ist am isoelektrischen Punkt minimal. Verwenden Sie verfügbare Webserver, um den pI-Wert für eine Peptidaminosäuresequenz zu berechnen.

Schreiben Sie die Peptidsequenz mit dem Ein-Buchstaben-Code. Wenn ein Peptid beispielsweise eine Aminosäuresequenz Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanin – Serin – Glumatsäure – Leucin – Prolin) aufweist, dann ist die Ein-Buchstaben-Sequenz "ASELP". Konsultieren Sie bei Bedarf die Umrechnungstabelle aus drei Buchstaben in einen Buchstaben in Ressourcen.

Verwenden Sie beispielsweise einen beliebigen Webbrowser, Internet Explorer oder Firefox, um zu einem Server zu navigieren, der den isoelektrischen Punkt (pI) des Peptids berechnet; siehe Ressourcen.

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Lesen Sie den Wert des isoelektrischen Punkts (pI) in der Zeile "Theoretischer pI/Mw" ab. In unserem Beispiel beträgt der pI 4,00. Beachten Sie, dass der Server auch das Molekulargewicht (Mw) des Peptids berechnet.

Über den Autor

Oxana Fox ist freiberufliche Autorin mit den Schwerpunkten Medizin und Behandlung, Computersoftware und -hardware, digitale Fotografie und Finanzdienstleistungen. Sie absolvierte 1988 das Moskauer Medical College mit einer formalen Ausbildung in Pädiatrie.

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Comstock Images/Comstock/Getty Images

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