Eine Zentrifuge ist ein Apparat, der aus einem Fach besteht, das sich um eine zentrale Achse dreht. Die Rotationsbewegung bewirkt, dass sich Materialien aufgrund ihrer unterschiedlichen Schwerkraft trennen. Ein Zentrifugenrotor ist die rotierende Einheit der Zentrifuge, die schräg gebohrte feste Löcher hat. Reagenzgläser werden in diese Löcher gelegt und der Rotor dreht sich, um die Trennung der Materialien zu unterstützen. Es gibt drei Arten von Zentrifugenrotoren: Ausschwing-, Festwinkel- und Vertikalrotoren.
Ein Ausschwingrotor unterstützt normalerweise Proben mit einem Volumen von 36 ml bis 2,2 ml. Swing-Buckets können zwei Arten von Separationen unterstützen: rate-zonal und isopycnic. Schwingeimer werden für geschwindigkeitszonenabhängige Trennungen bevorzugt, da der Abstand zwischen der Außenseite des Meniskus und der Außenseite des Bodens der Röhre groß genug ist, um eine Trennung durchzuführen.
Rotoren mit festem Winkel werden normalerweise für Pelletierungsanwendungen verwendet, um entweder Partikel aus einer Suspension zu pelletieren und überschüssigen Schmutz zu entfernen oder um das Pellet zu sammeln. Die Rotorkavitäten reichen von 0,2 ml bis 1 ml. Der wichtigste Aspekt bei der Entscheidung für einen Festwinkelrotor ist der K-Faktor. Der K-Faktor gibt an, wie effizient der Rotor bei maximaler Geschwindigkeit pelletieren kann. Je niedriger der K-Faktor, desto höher die Pelletiereffizienz.
Vertikalrotoren sind hochspezialisiert. Sie werden typischerweise verwendet, um DNA in Cäsiumchlorid zu banden. Vertikale Rotoren haben sehr niedrige K-Faktoren, was nützlich ist, wenn sich die Partikel nur eine kurze Strecke bis zur Pelletierung bewegen müssen. Die Laufzeit bei vertikalen Rotoren ist kurz.