Bakterier er små, encellede organismer, der både er gavnlige og skadelige for mennesker. Nogle former for bakterier hjælper os med at leve, såsom dem, der hjælper med at nedbryde mad i vores tarme. Andre former, såsom bakterierne, der forårsager Bubonic Plague, kan dræbe en person, hvis den ikke behandles. Der er mange forskellige typer bakterier, og de responderer ved hjælp af forskellige metoder. De to primære metoder til bakteriel respiration er aerob respiration og anaerob respiration.
Aerobisk respirerende former for bakterier kræver ilt for at leve. De bruger ilt som brændstof til at hjælpe med at forbrænde energi og give dem den nødvendige energi til livet. Denne type bakteriel åndedræt er den samme som mennesker bruger, deraf udtrykket "aerob træning." Det største biprodukt af aerob respiration fra bakterier er kuldioxid.
Mange typer bakterier responderer anaerobt. Med andre ord kan de gennemgå respirationsprocessen uden ilt til stede. I stedet for at bruge ilt til at hjælpe dem med at forbrænde energien i deres mad, bruger disse typer bakterier andre naturligt forekommende kemikalier til at skabe kemiske reaktioner og frigive den energi, de har brug for. Almindeligt anvendte naturligt forekommende kemikalier inkluderer nitrater, sulfater og kuldioxid. Anaerob respiration i bakterier skaber generelt mange biprodukter. Mange af disse biprodukter kan være giftige eller farlige for mennesker og inkluderer ethanol og brint.