Strukturen af deoxyribonukleinsyre - DNA - viste sig at være en dobbelt-helix for mange år siden, men konventionen om at navngive hver streng er blevet et emne for forvirring for både forskere og studerende. Blandt DNA-par kaldes den ene Watson og den anden Crick efter de to medopdagere af DNA. Men den videnskabelige litteratur er uenig i, hvilken streng der skal gives hvilket navn. Watson-Crick navngivningssystemet var beregnet til at indikere de forskellige funktionelle egenskaber for hver streng i DNA-strukturen, hvilket er det samme mål for de andre navngivningssystemer. Det er afgørende at forstå de forskellige sammenhænge, hvor de enkelte tråde har brug for at tage forskellige navne. To perfekte eksempler er deres forskellige roller i DNA-replikation eller transkription. At vide, hvad hver streng gør i en biologisk proces, hjælper med at afklare, hvorfor den fik det navn.
Anti-Sense er ikke noget vrøvl
Transkription er processen med at kopiere DNA til RNA. Det udføres af et enzym kaldet RNA Polymerase (RNA Pol). RNA Pol læser kun en af de to DNA-tråde, da det gør RNA-molekylet. Det dobbeltstrengede DNA-molekyle opdeles, og RNA Pol binder til en streng, som det vil læse og kopiere. Denne streng kaldes skabelonstrengen eller antisense-strengen. Det RNA-molekyle, der produceres, vil være komplementært til skabelonstrengen, hvilket betyder nukleotiderne af skabelonstreng og RNA-molekyle matcher med hinanden i henhold til reglerne: adenin til uracil og guanin til cytosin.
Denne giver mening
Når RNA transkriberes fra DNA, binder RNA Polymerase til og kopierer skabelonstrengen. Den resterende streng kaldes den kodende streng (se reference 5) eller sensestrengen. I betragtning af baseparringsreglerne for nukleinsyrer (A-par med T og G-par med C) har den kodende eller sense-streng af DNA en identisk sekvens med den af det RNA, der produceres. Undtagelsen her er, at RNA indeholder nukleotidet U (uracil) i stedet for T (thymin), som begge parres med A (adenin).
Glat ride
Inden mitose eller celledeling skal cellen replikere sit DNA, så hver dattercelle har et identisk antal DNA-tråde. DNA-polymerase er det enzym, der kopierer lange strækninger af DNA til mere DNA. Ved replikationsgaffelen udpakkes DNA-molekylet for at danne en boble, i hvilken Polymerase glider. Polymerase binder sig til begge tråde af det uopviklede DNA og begynder at lave kopier af begge tråde. En af kopierne er lavet som en enkelt kontinuerlig streng, der kaldes den førende streng. DNA-replikering er et andet tilfælde, hvor DNA-strengene har forskellige navne.
Stop og gå trafik
Den anti-parallelle struktur af DNA-stigen betyder, at den ene streng løber fra hoved til hale, mens den anden streng løber fra hale til hoved. Under DNA-replikering skal DNA-polymerase læse og kopiere begge tråde på samme tid, selvom de løber i modsatte retninger. Fordi DNA-polymerase kun kan læse og kopiere DNA-tråde i en retning - hale mod hoved - strengen at Polymerase-møder som orienteret i head-to-tail ikke kan læses og kopieres som en kontinuerlig strand. Denne head-to-tail-streng kopieres som korte fragmenter, kaldet Okazaki-fragmenter, som senere smeltes sammen til en lang streng. I DNA-replikation kaldes den streng, der dannes i fragmenter, den forsinkede streng.