Et fylogenetisk træ er en grafisk repræsentation af evolutionære forhold, der viser, hvordan organismer muligvis kunne have afviget fra en fælles forfader. Tidligere blev dette gjort ved sammenligning af anatomi og fysiologi af levende organismer og fossiler, men nu bruges ofte genetisk information taget fra DNA-nukleotidsekvenser. Organismer med få ligheder kan findes på de separate "grene" af et fylogenetisk træ, og dem med specifikke fællestræk ville være placeret på "kviste" i den samme gren. Et fylogenetisk træ er en metode til forståelse af arter og evolutionære ændringer i organismer.
Vælg en modelorganisme til forholdssammenligning. Dette kan gøres med en art, race eller nukleotidsekvens, der repræsenterer en organisme. Et eksempel på en organisme kan være en ko. Resten af træet vil demonstrere, hvor tæt beslægtet en ko er med andre organismer baseret på genetiske træk.
Vælg en udgruppe. En udgruppe er en mindre nært beslægtet organisme eller meget forskellig nukleotidsekvens. Hvis modelorganismen er en ko, ville en mulig udgruppe være en fisk. Jo mere forskellige to organismer er, jo længere nede på det fylogenetiske træ vil deres divergerende forgreningspunkt være. Tid er repræsenteret med den ældste dato i bunden af diagrammet, og nutiden er øverst i diagrammet. Grenernes placering viser omtrent, hvornår et evolutionært træk muligvis ændrede en forfædres organisme til forskellige arter.
Bestem et sæt egenskaber, der skal bruges til sammenligning. Eksempler inkluderer "har fire ben", "tygger cud", "føder levende fødsel" eller "vokser hår." Nukleotidsekvenser er bare alfabetiske repræsentationer af DNA, der bestemmer karakteristika, så en anden mulighed ville være: "indeholder sekvensen ATGGACACGGA. "
Opdel organismer baseret på karakteristika. Når en organisme ikke indeholder det ønskede træk, dannes en gren i det fylogenetiske træ. For det karakteristiske ”har fire ben”, ville køer, får og hjorte alle være på en gren, mens fisk ville være på en separat gren. Indsæt billedet eller sekvensen af en ko i det øverste hjørne af plakatbrættet og fiskene i det modsatte hjørne, og træk to linjer fra dem til bunden af papiret i en krydsende V-form.
Fortsæt med at adskille modelorganismerne eller nukleotidsekvenserne, indtil hvert eksempel har en enkelt adskillelse fra grenen til en kvist. Det karakteristiske ”har uld” adskiller får fra hjorte og køer på en enestående gren. Anbring fårebilledet i nærheden af billedet af fisken og træk en linje, der forbinder i V-form ned til grenen af koen. Brug af karakteristikken "har blød hale" ville afgrænse ko fra hjorte. Indsæt billedet af hjorten mellem ko og får, og træk en anden linje til en V-form, der krydser over fisk og fårelinjer. Når hver art har en enkelt gren, er det fylogenetiske træ afsluttet.
