Enzymer er proteinmaskiner, der har brug for at påtage sig 3D-former for at fungere korrekt. Enzymer bliver inaktive, når de mister deres 3D-struktur. En måde dette sker på er, at temperaturen bliver for varm, og enzymet denaturerer eller udfolder sig. En anden måde, hvorpå enzymer bliver inaktive, er når deres aktivitet er blokeret af en kemisk hæmmer. Der er forskellige typer hæmmere. Konkurrerende hæmmere binder til og blokerer enzymets aktive sted. Ikke-konkurrerende hæmmere binder til et andet sted end det aktive sted, men får det aktive sted til at være ikke-funktionelt.
Denatureret af varme
Atomer i enzymer vibrerer normalt, men ikke så meget, at molekylet udfolder sig. Forøgelse af enzymets temperatur øger vibrationsmængden. For meget jiggling og enzymet begynder at miste sin korrekte form. Enzymer har et optimalt temperaturinterval, hvor de er mest aktive. Enzymaktivitet øges, når temperaturen når dette optimale interval, men falder kraftigt, når dette interval er passeret. De fleste dyreenzym mister aktivitet over 40 grader Celsius. Der er bakterier kaldet ekstremofiler, der kan overleve i varme kilder. Deres enzymer kan modstå temperaturer, der koger vand.
Aktivt websted
Enzymer har en region kaldet det aktive sted, som er ansvarlig for at udføre den kemiske reaktion, der er enzymets hovedformål. Ligesom resten af enzymet skal det aktive sted have en ordentlig 3-D-form for at arbejde. Det aktive sted er som enzymets mund. Sidegrupperne af visse aminosyrer holder sig fast i rummet på det aktive sted, ligesom tænder i munden. Disse sidegrupper er ansvarlige for at få den kemiske reaktion til at ske. Ligesom tænderne skal justeres for at tygge mad, kan sidegrupperne ikke fuldføre reaktionerne, hvis det aktive sted ikke er i sin 3D-form.
Konkurrencedygtige hæmmere
En anden måde, hvorpå enzymer bliver mindre effektive, er, at deres aktivitet er blokeret af en kemisk hæmmer. Konkurrerende hæmmere er molekyler, der binder til det aktive sted i enzymet. Det aktive er, hvor substratet, molekylet, som enzymet skal modificere, binder, så den konkurrerende inhibitor konkurrerer med substratet om det aktive sted. Mange konkurrerende hæmmere er kendt som reversible hæmmere, for selvom de binder det aktive sted, kan de falde af. Dette tænder enzymet igen.
Ikke-konkurrencedygtige hæmmere
En anden type enzymhæmmer kaldes ikke-konkurrerende hæmmere. Disse kemikalier binder ikke til det aktive sted, men til et andet sted på enzymet. Imidlertid forårsager bindingen af inhibitoren på det andet sted en ændring i formen af proteinet, som enten lukker eller blokerer det aktive sted. Ikke-konkurrerende hæmmere kaldes også allosteriske hæmmere, da allosteriske steder er regulatoriske steder, der ikke er det aktive sted. Nogle enzymer er flere enzymer, der samles i det, der kaldes et enzymkompleks. En allosterisk hæmmer kan slukke for alle enzymer i et kompleks ved at binde til et allosterisk sted.