Et naturligt vådområde er et komplekst økosystem. Ligesom andre økosystemer, hvad enten det er land- eller vandbaseret, påvirker mange faktorer vådområdernes form og funktion. Både biotiske og abiotiske faktorer og processer er integreret i det naturlige vådlandsøkosystem. Udtrykket "biotisk" henviser til levende ting. Udtrykket "abiotisk" henviser til de materialer, processer eller faktorer, der ikke lever.
Vand
Selve vandet er måske den væsentligste abiotiske faktor i naturlige vådområder. Selvom det er vigtigt for næsten alle biologiske processer, er vandet ikke levende, og det kan forekomme uafhængigt af levende ting. I naturlige vådområder er vand det medium, hvor hele økosystemet eksisterer og fungerer. Vådområder i regioner, der tidligere har været isbreede - i form af massive isark - skylder muligvis deres tidlige begyndelse til gletschers kraftige udskæringseffekter. Så selv vand i den dramatisk forskellige form var en væsentlig faktor i udviklingen af vådområderne.
Luft
I modsætning til vand består luft af mere end en kemisk forbindelse. Oxygen, nitrogen, kuldioxid og flere andre luftformige stoffer danner luftens kemiske sammensætning. Luft, især ilt indeholdt i den, er en anden kritisk abiotisk faktor i naturlige vådområder. Næsten ethvert vådområder økosystem har mange slags planter og dyr. Grønne planter bruger kuldioxid fra luften; til gengæld frigiver de ilt som et affaldsprodukt. Dyr gør det omvendte; de optager og bruger ilt og afgiver kuldioxid som affaldsprodukt. Selvom der er organismer, der kan og lever og vokser i fravær af ilt, er langt de fleste af livsformer i et naturligt vådområde - både under vandet og over dets overflade - kræver ilt fra luft.
Sollys
Lys fra solen er en væsentlig abiotisk faktor i naturlige vådområder. Sollys giver den energi, planter har brug for til at udføre fotosyntese. Den samme energi overføres til andre organismer i vådlandet gennem fødekæden eller fødevævet. Og temperatur er selvfølgelig en abiotisk faktor, der er direkte relateret til den mængde energi vådområdet modtager fra solen.
Mineraler
Under vandet, i bunden af et naturligt vådområde, er sedimentære materialer af forskellige slags. Meget af dette materiale er organisk eller biotisk og stammer fra de nedbrydende rester af levende organismer i vådlandet. Men der er også en mineralsk komponent i dette sedimentære materiale. Mineralpartikler af forskellige slags og størrelser blandes med det organiske materiale. Ligesom i terrestriske økosystemer skal planter i det naturlige vådområde få abiotiske mineral næringsstoffer for at leve og vokse. Og mineraler er ikke begrænset til bundbunden; de kan opløses direkte i vandet, hvor de danner en kompleks naturlig kemisk blanding, der har indflydelse på faktorer som pH, et mål for surheden i vandet.
Klipper
Ud over de relativt små partikler af mineralske sedimenter er der ofte større klipper i forskellige størrelser og slags i vådområder. Uanset om det er et massivt, kontinuerligt lag af grundfjeld, der ligger bag vådområdet og danner dets fundament, eller relativt mindre klipper, der er under vandet, eller som stikker ud over overfladen, er klipper en væsentlig abiotisk faktor i mange vådområder. Udover at give substrater til planter og dyr til enten at vokse på eller aborre på, klipper igennem naturlige vejrprocesser - gradvist nedbrydes og tilføres mineralsk næringsstoffer til vådområdet økosystem.