Selvom de dybe, mørke omgivelser i huler ser ud som om de aldrig kunne understøtte plantelivet, trives visse typer flora i det miljø. Grotter har tendens til at være fugtige og have en konstant temperatur, en økologi, der er ideel til planter som svampe, mos og alger. Planter kan endda vokse i de elektriske lys, som mennesker medbringer til udforskning af huler.
Grottezoner
Huler er opdelt i tre zoner: indgang, tusmørke og mørke. Indgangszonen har stadig masser af lys til at understøtte mange typer planter såsom træer og græs. I tusmørkezonen er noget lys i stand til at trænge ind, men det er ikke nok til at understøtte de fleste typer planteliv. Imidlertid er nogle planter i stand til at overleve i denne zone, for eksempel mos og bregner. Den mørke zone har intet naturligt lys og kan kun understøtte de hårdeste planter som svampe og alger.
Planter i Twilight Zone
Når mængden af lys falder, falder også plantelivets størrelse og kompleksitet. Så hvorimod der kan vokse blomstrende planter i indgangsområdet, er tusmørkezonen typisk præget af mos og bregner. Planter, der lever i denne region af hulen, har udviklet tilpasninger, der gør det muligt for dem at leve under sådanne dårlige lysforhold. En sådan tilpasning er, at deres kloroplaster, de solfangstmolekyler i en plante, alle samles ved kanten af cellen, der er tættest på lyskilden.
Planter i den mørke zone
Selvom der næsten ikke er noget lys i den mørke zone, kan planter stadig vokse. Især svampe er dygtige til at leve på disse mørke steder. Svampe trives især godt, fordi huler er fulde af næringsrige flagermusguano, en perfekt jord til svampe. Alger kan også leve i de mørkeste dele af huler. I stedet for at bruge fotosyntese kan disse alger bruge en anden metabolisk vej til at producere deres energi.
Lampenflora
Planter kan også vokse i huler udstyret med elektriske lys. Disse planter, kendt som lampenflora, har en tendens til at være mindre livlige i farve og noget vansiret. Lampenflora er typisk mos, bregner og alger. I huler, der konstant tændes af lamper, kan disse invasive planter forårsage problemer med hulens naturlige struktur eller enhver forhistorisk vægkunst. På grund af deres skadelige natur styres lampenflora typisk gennem fysiske, kemiske og biologiske metoder.
