Mennesker er afhængige af økosystemer for at levere mad og andre fornødenheder til et sundt menneskeliv. Visse menneskelige aktiviteter har dog haft en ødelæggende indvirkning på økosystemer. Fra forurening til overhøstning har skader og udnyttelse af dyrelivet og naturlig vegetation af mennesker efterladt nogle økosystemer i dårlig form.
Økosystemforurening
Mange biprodukter fra industrialisering har skadet økosystemer. For eksempel brænder kul for at producere energi frigiver kemikalier som svovldioxid. Sådanne kemikalier i luften fører til sur regn og syreaflejring, som kan skade plante- og dyreliv, især da det forsurer vandlevende økosystemer. Derudover kan flydende kemisk afstrømning fra menneskelige aktiviteter påvirke økosystemer negativt. En sådan afstrømning produceres ikke kun af store industrifabrikker. Zink- og blyafstrømning fra græsplæner, indkørsler og fortove i boligområder kan skade økosystemer.
Byudbredelse
Byspredning er den stadigt stigende spredning af byer ud i tidligere landdistrikter. Der er sket en gennemskæring og skovrydning for at imødekomme urbaniseringens skub i landdistrikterne. Udover at resultere i tab af skove og anden vegetation, fører sådanne aktive stoffer til fragmentering af levesteder. Når veje, hjem eller endda køretøjer skærer igennem den oprindelige økosystemsammensætning, kan dyr afskæres fra en stor del af deres levested og i forlængelse heraf deres population.
Introduktion af invasive arter
Overførsel af arter kan være utilsigtet, f.eks. En plantespore, der sætter en tur på en sko. Eller introduktionen af en ny art kunne være med vilje, som det var tilfældet med den asiatiske karpe i USA. Ifølge National Wildlife Federation er 42 procent af truede dyr truet af ikke-indfødte arter. Disse arter udgør et problem, fordi de konkurrerer om mad og muligvis ikke tjener som god mad til de indfødte arter. Derudover kan invasive arter mindske biodiversiteten og ændre økosystemet fysisk. For eksempel kan en invasiv art ændre jordens kemiske sammensætning.
Overhøstning af økosystemer
Overhøstning, undertiden kaldet overudnyttelse, sker, når arter tages fra deres naturlige habitat. Dette kan ske som et resultat af ødelæggelse af levesteder, men oftere er det et resultat af jagt eller fiskeri. Sådanne uholdbare aktiviteter kan især ses i fiskerisektoren, hvor arter som torsk, kuller og skrubbe har fået deres bestand drastisk reduceret. Overhøstning kan føre til ubalance i økosystemer, forstyrre fødekæden og skade andre ikke-høstede arter.