Det hele begynder ved rødderne. Planter får næringsstoffer fra to forskellige systemer - den ene begynder i bladene og er ansvarlig for fotosyntese. Den anden begynder ved rødderne og flytter vand fyldt med opløste ioner op gennem planten. Protein er et af de næringsstoffer, der begynder ved rødderne og arbejder sig opad.
Planter er autotrofer
Planter er autotrofer. I modsætning til dyr, som skal få deres mad fra eksterne kilder som planter og andre dyr, er planter i stand til at fremstille deres egne. Planter tager grundlæggende elementer fra omverdenen og bringer dem ind i deres kroppe, hvor de omdannes til stivelse og proteiner, der kan bruges af planten eller af det dyr, der spiser den.
Kvælstof og bakterier
Protein er lavet af nitrat, en form for nitrogen, der er fikseret af mikroorganismer. Planter kan ikke bruge kvælstof direkte, så de er afhængige af bakterier til at omdanne kvælstof til en form, de kan bruge. Disse bakterier opholder sig nær planterødderne eller i specielle strukturer på rødderne kaldet knuder. Bakterierne i knuder har dannet et symbiotisk forhold til planterne, hvor de bytter anvendeligt kvælstof til sukker fra planten.
Nitrater og aminosyrer
Nitrater, der føres ind i planten gennem rødderne, trækkes ind i planten, hvor de omdannes til 20 forskellige slags aminosyrer. Disse aminosyrer omdannes til proteiner i specielle strukturer i cellerne kaldet ribosomer. Disse strukturer ligger fire steder i anlægget. Nogle flyder frit i cellernes cytoplasma, mens andre er fastgjort til overfladen af det endoplasmatiske retikulum, mitokondrierne og kloroplasterne.
Protein transport
Fra ribosomerne indeholdt i det endoplasmatiske retikulum sendes proteinerne ind i golgi-apparatet. Golgi-apparatet sorterer disse proteiner til distribution i hele planten, hvor de vil blive brugt til at danne nye strukturer til yderligere næringstransport samt grundlæggende metaboliske processer.