Selvom naturlige kræfter kan ødelægge eller belaste en dyrepopulation, har menneskets aktiviteter i stigende grad medført, at et stort antal dyr er truet. Visstnok har nogle dyr og planter, især husdyr som afgrøder, husdyr og kæledyr, haft gavn og endda blomstret af de ændringer, mennesket har foretaget i verden. Imidlertid er nogle dyrepopulationer blevet underlagt et enormt pres som følge af disse ændringer, og i nogle tilfælde falder populationerne til betydeligt lavere niveauer. Små populationer eller organismer med en begrænset fordeling er ekstremt følsomme over for de faktorer, der forårsager fare, uanset om man stoler på ordets almindelige betydning eller definitionen af truede arter, der er indeholdt i føderal lov.
Tab af habitat
En af de mest betydningsfulde årsager til truede dyr er tab af levesteder. Mens habitat kan gå tabt på grund af naturlige kræfter (klimaforskydninger, geologiske ændringer), skyldes meget af det habitat, der er tabt i dag, menneskelig aktivitet. Opførelsen af dæmninger, motorveje, kanaler, urbanisering og landbrug påvirker indbyggerne i oprindelige økosystemer dramatisk. Selv når dele af økosystemet forbliver intakte og skaber "øer", kan det resulterende habitat være for lille eller for vidt spredt til at understøtte en art.
Invasive arter
Invasive arter er en af de vigtigste biotiske årsager til, at dyr er truet. Mange arter, der ankommer til et nyt økosystem, er dårligt tilpassede og dør hurtigt af. Imidlertid er nogle arter i stand til at udnytte økosystemet til skade for indfødte organismer. Små økosystemer som dem på øerne er væsentligt påvirket af introduktionen af invasive arter, men selv indfødte kontinentale og oceaniske befolkninger kan blive ødelagt gennem konkurrence eller rovdyr af angriber.
Overudnyttelse af ressourcer
Overfiskning af en bestemt fiskeart er en åbenbar og direkte årsag til, at et dyr bliver truet. Men andre organismer i økosystemet kan også blive skadet (eller draget fordel) af overudnyttelse af en bestemt art. For eksempel førte bekymring over, at den californiske havotter havde ødelagt abalone-befolkningen vilkårlig drab på havodderne, hvilket ændrer balancen i den biotiske konkurrence mellem flere organismer. Reduktionen af havterde førte til en eksplosion i bestanden af søpindsvin, der græssede på tangens lastrum. Da tangen brød fri fra bunden og skyllede i land, blev organismer, der var afhængige af tangeskovene, anbragt under øget belastning.
Patogener og sygdomme
Spredningen af tamme dyr har også spredt de sygdomme, der er forbundet med dem, til nye områder i verden. I nogle tilfælde inficerede sygdommene indfødte befolkninger, som havde ringe modstand mod det invaderende patogen. Disse sygdomme kan nå epidemieniveauer i den indfødte befolkning og decimere deres antal.
Miljøforurening
Forurening i mange former har truet mange dyr i fare. Pesticider og andre kemikalier, der introduceres i et økosystem, kan skade ikke-målrettede arter betydeligt. For eksempel blev DDT, der bruges til at bekæmpe myg, til sidst knyttet til fald i reproduktionshastigheden for fugle. Andre former for forurening, såsom varme-, lys- og støjforurening, kan hver især reducere overlevelsesgraden for lokale dyrepopulationer.