Meget få bakterier producerer endosporer. Kun nogle af disse arter i Firmicute phylum producerer endosporer, som er ikke-reproduktive strukturer, der indeholder DNA og en del af cytoplasmaet. Endosporer er ikke sande sporer, da de ikke er afkom af bakterien. Endosporer dannes, når bakterier udsættes for ekstreme eller ugunstige miljøforhold. De kan overleve i lange perioder, selv når de sulter af mad og når de udsættes for kemikalier og temperaturer, der normalt dræber bakterierne.
Bacillus Bakterier
Bakterier i slægten Bacillus er den hyppigst undersøgt af alle endosporeproducerende bakterier. Bacillus-bakterier er forskellige og trives i mange forskellige miljøer. Endosporer af denne bakterie er meget giftige for mange organismer, inklusive mennesker. Patogenet Bacillus anthracis er et velkendt toksin, der er blevet brugt af både forskere og terrorister. Der er dog mange andre arter af Bacillus.
Clostridium-bakterier
Ligesom andre arter af endosporeproducerende bakterier er Clostridium-bakterier gram-positive, hvilket indikerer, at de har lignende egenskaber såsom cellevægsstruktur. Grampositive bakterier er følsomme over for de samme eller nært beslægtede antibiotika. Bakterier i slægten Clostridium er ansvarlige for en bred vifte af menneskelige sygdomme lige fra mild madforgiftning til botulisme såvel som stivkrampe og gasgangren.
Desulfotomaculum-bakterier
I lighed med andre endosporeproducerende bakterier er bakterier i slægten Desulfotomaculum også ansvarlige for madspild og sygdom. Desulfotomaculum-bakterier kan få dårlige dåse fødevarer til at ødelægge. Hvor de er i overflod, producerer de en ubehagelig svovllignende lugt.