El Paso amt ligger i West Texas. Byen El Paso ligger på amtets sydligste spids. Det er her, mange af amtets forureningsproblemer stammer fra. Byen El Paso deler en fælles grænse med Ciudad Juarez i Mexico. De to byer er delt med Rio Grande-floden. Ud over den delte grænse deler de også en vandforsyning og et luftskur på grund af deres indhegning i en dal mellem to bjergkæder.
El Paso deler et luftskur med den mexicanske by Ciudad Juarez. Denne luftskur, kendt som Paso del Norte, sidder i et bassin, der består af bjergene, der omgiver de to byer. Inden for luftboden er synligheden ofte dårlig, og åndedrætsproblemer hyppige. Paso del Norte's luftproblemer stammer fra en række emissionskilder kombineret med uheldige meteorologiske forhold. El Paso opfylder ikke amerikanske føderale luftkvalitetsstandarder og er derfor udpeget som et føderalt område, der ikke er opnåeligt. Det overstiger de niveauer, der anses for sikre for ozon, kulilte og PM-10. Et indeks udviklet til at bedømme byer i henhold til vægtede skøn over eksponering for luftforurenende stoffer rangerede El Paso som landets sjette værste.
Mange giftige kemikalier fra industrielle og landbrugskilder finder vej ind i Rio Grande-floden. I 1995 var der mere end 1.400 industrianlæg i grænseområdet. I samme år blev der fundet 30 potentielt skadelige kemikalier i floden, der oversteg screeningsniveauerne. Disse omfattede arsen, cadmium, krom, kobber, bly, nikkel, selen, zink og kviksølv. Fra 2002 rangerer El Paso i de værste 60 procent af byerne med hensyn til dets største kemiske frigivelser og deres dermed forbundne kræftrisici, udviklingstoksiske stoffer og reproduktionstoksiske stoffer.
Bly er den mest almindelige jordforurening i El Paso efterfulgt af kobber. El Paso har to faciliteter, der er ansvarlige for frigivelse af giftige kemikalier i landet. Disse er US Army Air Defense Artillery Center og Phelps Dodge Copper Products Company.