Na Zemi pohání vítr sluneční energie; takže na Neptunu, kde se slunce nezdá o moc větší než hvězda, byste očekávali slabý vítr. Opak je však pravdou. Neptun má nejsilnější povrchové větry ve sluneční soustavě. Většina energie podporující tyto větry pochází z planety samotné.
Ve srovnání s kteroukoli z plynných obřích planet je zemská atmosféra zásobárnou klidu. Na Jupiteru větry v Malé červené skvrně dosahují 618 kilometrů za hodinu (384 mil za hodinu), což je téměř dvakrát rychlejší než vítr v nejtvrdším suchozemském hurikánu. Na Saturnu může vítr v horních vrstvách atmosféry foukat téměř třikrát silněji, a to rychlostí 1 800 kilometrů za hodinu (1118 mil za hodinu). I tyto větry ustupují do pozadí poblíž Neptunovy Velké temné skvrny, kterou astronomové dosáhli rychlosti 1 931 kilometrů za hodinu (1 200 mil za hodinu).
Stejně jako Jupiter a Saturn, i Neptun generuje více energie, než kolik přijímá ze slunce, a tato energie vyzařující z jádra planety pohání silné přízemní větry. Jupiter vyzařuje energii, která zbyla z jejího vzniku, a energie, kterou vyzařuje Saturn, je do značné míry výsledkem tření produkovaného heliovým deštěm. Na Neptunu zachycuje teplo metan - což je skleníkový plyn. Pokud by planeta byla jako Uran (který postrádá vnitřní zdroj energie), toto teplo by už dávno vyzařovalo do vesmíru. Místo toho, i když jsou teploty chladné, planeta vyzařuje 2,7krát více tepla, než kolik přijímá ze slunce, což je dost na to, aby pohánělo její prudké větry.